RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 KIF13AQ9H1H9 1805 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 ARHGAP5Q13017 1502 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 ABCA9Q8IUA7 1624 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 MYO5CQ9NQX4 1742 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 PLCH2O75038 1416 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 TLR3O15455 904 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM201Q5SNT2 666 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 HS2ST1Q7LGA3 356 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 ERMP1Q7Z2K6 904 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 REC114Q7Z4M0 266 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 PHACTR4Q8IZ21 702 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 FLAD1Q8NFF5 587 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 COPRSQ9NQ92 184 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 PTPN23Q9H3S7 1636 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 HTR3BO95264 441 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 CHMP4BP1P59074 171 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 FAM196AQ6ZSG2 479 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 FBXO27Q8NI29 283 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 GGT7Q9UJ14 662 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 KCNH3Q9ULD8 1083 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 CTNND2Q9UQB3 1225 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 ITSN2Q9NZM3 1697 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-211ENST00000484135 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 PREX2Q70Z35 1606 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 MLECQ14165 292 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 KCNMB1Q16558 191 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 FBXL19Q6PCT2 694 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 ZSWIM9Q86XI8 627 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 SLFN12Q8IYM2 578 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 Q96M66 194 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 FANCAO15360 1455 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 GLI2P10070 1586 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 PRR36Q9H6K5 1346 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 RAPGEF3O95398 923 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 GARTP22102 1010 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 AFAP1Q8N556 730 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 RNF141Q8WVD5 230 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 ALPK1Q96QP1 1244 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 SLAMF8Q9P0V8 285 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 AKNAQ7Z591 1439 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 MIA2Q96PC5 1412 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 AFMP43652 599 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 CREG2Q8IUH2 290 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 DTWD2Q8NBA8 298 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM40Q8WWA1 233 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC120Q96HB5 630 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC74BQ96LY2 380 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 GPATCH2Q9NW75 528 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 PTPRKQ15262 1439 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 SCAPERQ9BY12 1400 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 GBP1P32455 592 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM87AQ8NBN3 555 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 KIF2CQ99661 725 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 BRMS1Q9HCU9 246 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 DUSP13Q9UII6 198 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 SYCP2Q9BX26 1530 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 ADGRL1O94910 1474 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 ROBO2Q9HCK4 1378 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 WASH4PA8MWX3 477 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 DNAJA2O60884 412 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 GDNFP39905 211 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 KIRREL1Q96J84 757 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 KREMEN1Q96MU8 473 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 ASPNQ9BXN1 380 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 LRRC3Q9BY71 257 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 KCNQ5Q9NR82 932 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 ABCC5O15440 1437 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 MBD5Q9P267 1494 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 ABCC1P33527 1531 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 LRRC10BA6NIK2 292 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 LRRN2O75325 713 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 ESR1P03372 595 aa6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms