RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF236Q9UL36 1845 aa11.51□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 LRRC37A2A6NM11 1700 aa11.5□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 SURF6O75683 361 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 MYOGP15173 224 aa11.5□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 RABGGTBP53611 331 aa11.5□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 ATP8B2P98198 1209 aa11.5□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 LBX2Q6XYB7 198 aa11.5□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 RNF180Q86T96 592 aa11.5□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa11.5□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 GINM1Q9NU53 330 aa11.5□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 SMIM22K7EJ46 135 aa11.49□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 RFXAPO00287 272 aa11.49□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 TLL1O43897 1013 aa11.49□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 ERCC3P19447 782 aa11.49□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 CYP7A1P22680 504 aa11.49□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 PPP2R2DQ66LE6 453 aa11.49□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 KRT40Q6A162 431 aa11.49□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 CCDC174Q6PII3 467 aa11.49□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 ACER1Q8TDN7 264 aa11.49□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 HERVK_113Q902F9 699 aa11.49□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 MAML3Q96JK9 1138 aa11.49□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 TOX2Q96NM4 488 aa11.49□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 CD320Q9NPF0 282 aa11.49□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 STARD7Q9NQZ5 370 aa11.49□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 IGSF3O75054 1194 aa11.48□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 IDH1O75874 414 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 HLA-DOAP06340 250 aa11.48□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 RLBP1P12271 317 aa11.48□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 ACLYP53396 1101 aa11.48□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 NHLH1Q02575 133 aa11.48□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 MIGA1Q8NAN2 632 aa11.48□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 SPATC1LQ9H0A9 340 aa11.48□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 MYO9BQ13459 2157 aa11.48□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 PI4K2BG5E9Z4 385 aa11.47□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 STRNO43815 780 aa11.47□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 ADAMTS4O75173 837 aa11.47□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 RAB3GAP1Q15042 981 aa11.47□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 OTOP2Q7RTS6 562 aa11.47□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 ITPRIPQ8IWB1 547 aa11.47□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM199Q8N511 208 aa11.47□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 MAGEB6Q8N7X4 407 aa11.47□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 UIMC1Q96RL1 719 aa11.47□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa11.47□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 MTCH2Q9Y6C9 303 aa11.47□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 ROBO3Q96MS0 1386 aa11.46□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa11.46□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 MYADML2A6NDP7 307 aa11.46□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 EPOPA6NHQ4 379 aa11.46□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 PRR33A8MZF0 331 aa11.46□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 CYP2C18P33260 490 aa11.46□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 USP14P54578 494 aa11.46□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 PLS1Q14651 629 aa11.46□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 TATDN1Q6P1N9 297 aa11.46□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 NCAPG2Q86XI2 1143 aa11.46□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 CERS3Q8IU89 383 aa11.46□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 EHD4Q9H223 541 aa11.46□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 CERS4Q9HA82 394 aa11.46□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC5A4Q9NY91 659 aa11.46□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 SERPINB13Q9UIV8 391 aa11.46□□□□□ -0.57
SMARCE1-210ENST00000481231 WDFY4Q6ZS81 3184 aa11.46□□□□□ -0.58
SMARCE1-210ENST00000481231 GBF1Q92538 1859 aa11.45□□□□□ -0.58
SMARCE1-210ENST00000481231 TRANK1O15050 2925 aa11.45□□□□□ -0.58
SMARCE1-210ENST00000481231 UMODL1Q5DID0 1318 aa11.45□□□□□ -0.58
SMARCE1-210ENST00000481231 PGK2P07205 417 aa11.45□□□□□ -0.58
SMARCE1-210ENST00000481231 USP5P45974 858 aa11.45□□□□□ -0.58
SMARCE1-210ENST00000481231 KCNA10Q16322 511 aa11.45□□□□□ -0.58
SMARCE1-210ENST00000481231 SHCBP1Q8NEM2 672 aa11.45□□□□□ -0.58
SMARCE1-210ENST00000481231 NUP133Q8WUM0 1156 aa11.45□□□□□ -0.58
SMARCE1-210ENST00000481231 TANGO6Q9C0B7 1094 aa11.45□□□□□ -0.58
SMARCE1-210ENST00000481231 ANTXR1Q9H6X2 564 aa11.45□□□□□ -0.58
SMARCE1-210ENST00000481231 IL23AQ9NPF7 189 aa11.45□□□□□ -0.58
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A0G2JMZ2 1700 aa11.44□□□□□ -0.58
SMARCE1-210ENST00000481231 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
SMARCE1-210ENST00000481231 FGBP02675 491 aa11.44□□□□□ -0.58
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
SMARCE1-210ENST00000481231 AKR1A1P14550 325 aa11.44□□□□□ -0.58
SMARCE1-210ENST00000481231 SHMT1P34896 483 aa11.44□□□□□ -0.58
SMARCE1-210ENST00000481231 ABCB5Q2M3G0 1257 aa11.44□□□□□ -0.58
SMARCE1-210ENST00000481231 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
SMARCE1-210ENST00000481231 CEP85Q6P2H3 762 aa11.44□□□□□ -0.58
SMARCE1-210ENST00000481231 AACSQ86V21 672 aa11.44□□□□□ -0.58
SMARCE1-210ENST00000481231 HLA-CQ95604 372 aa11.44□□□□□ -0.58
SMARCE1-210ENST00000481231 FBXL18Q96ME1 805 aa11.44□□□□□ -0.58
SMARCE1-210ENST00000481231 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
SMARCE1-210ENST00000481231 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
SMARCE1-210ENST00000481231 COG5Q9UP83 839 aa11.44□□□□□ -0.58
SMARCE1-210ENST00000481231 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa11.44□□□□□ -0.58
SMARCE1-210ENST00000481231 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
SMARCE1-210ENST00000481231 CACNA1AO00555 2505 aa11.43□□□□□ -0.58
SMARCE1-210ENST00000481231 MROH7Q68CQ1 1323 aa11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.3 ms