RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477448.1

SOBP-202, Transcript of sine oculis binding protein homolog, humanhuman

TSL 5

Gene SOBP, Length 1,535 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBP-202ENST00000477448 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa30.17■■■□□ 2.42
SOBP-202ENST00000477448 DTNBO60941 627 aa30.16■■■□□ 2.42
SOBP-202ENST00000477448 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
SOBP-202ENST00000477448 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa30.16■■■□□ 2.42
SOBP-202ENST00000477448 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
SOBP-202ENST00000477448 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa30.15■■■□□ 2.42
SOBP-202ENST00000477448 CPLX1O14810 134 aa30.15■■■□□ 2.42
SOBP-202ENST00000477448 DDIT3P35638 169 aa30.15■■■□□ 2.42
SOBP-202ENST00000477448 GRM4Q14833 912 aa30.15■■■□□ 2.42
SOBP-202ENST00000477448 NTRK3Q16288 839 aa30.15■■■□□ 2.42
SOBP-202ENST00000477448 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
SOBP-202ENST00000477448 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
SOBP-202ENST00000477448 JAK2O60674 1132 aa30.14■■■□□ 2.42
SOBP-202ENST00000477448 SCYL3Q8IZE3 742 aa30.14■■■□□ 2.42
SOBP-202ENST00000477448 SAGE1Q9NXZ1 904 aa30.14■■■□□ 2.42
SOBP-202ENST00000477448 TBC1D8O95759 1140 aa30.13■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 GJB2P29033 226 aa30.13■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 SREBF2Q12772 1141 aa30.13■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 TNS4Q8IZW8 715 aa30.13■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 OTUD5Q96G74 571 aa30.13■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa30.13■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa30.13■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 MTMR7Q9Y216 660 aa30.13■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 A0A1W2PRG0 241 aa30.12■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 PTPDC1A2A3K4 754 aa30.12■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 RASGRP2Q7LDG7 609 aa30.12■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 SNHG28P0DPA3 235 aa30.12■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 PDHBP11177 359 aa30.12■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 KIF5BP33176 963 aa30.12■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 MAD2L2Q9UI95 211 aa30.12■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 CDKL5O76039 1030 aa30.11■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 IFNAR1P17181 557 aa30.11■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 ACER1Q8TDN7 264 aa30.11■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa30.11■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 TMX2Q9Y320 296 aa30.11■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa30.1■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP30.1■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 TMTC3Q6ZXV5 915 aa30.1■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 MS4A4AQ96JQ5 239 aa30.1■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 PTPN18Q99952 460 aa30.1■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 SPDYE5A6NIY4 337 aa30.09■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 USP17L5A8MUK1 530 aa30.09■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 PLEKHA8P1O95397 391 aa30.09■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 ERO1BQ86YB8 467 aa30.09■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 IFNL1Q8IU54 200 aa30.09■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 STAG2Q8N3U4 1231 aa30.09■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa30.09■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 DDX11Q96FC9 970 aa30.09■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 PICK1Q9NRD5 415 aa30.09■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 PPFIA3O75145 1194 aa30.08■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 USP17L2Q6R6M4 530 aa30.08■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
SOBP-202ENST00000477448 FDPSP14324 419 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 PTPRAP18433 802 aa30.07■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 INHBEP58166 350 aa30.07■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 FUT2Q10981 343 aa30.07■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 NBPF11Q86T75 865 aa30.07■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 PHKBQ93100 1093 aa30.07■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 SH2D4AQ9H788 454 aa30.07■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 F5H6K3 240 aa30.06■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 IRF6O14896 467 aa30.06■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 GNAQP50148 359 aa30.06■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 KLRC3Q07444 240 aa30.06■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 SLFN13Q68D06 897 aa30.06■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa30.06■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 STK36Q9NRP7 1315 aa30.06■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 GOLGA8HP0CJ92 632 aa30.06■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 ASPRV1Q53RT3 343 aa30.06■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 DCAF4Q8WV16 495 aa30.06■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 BRI3BPQ8WY22 251 aa30.06■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 PTPRFP10586 1907 aa30.05■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 NDUFB10O96000 172 aa30.05■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 ZNF543Q08ER8 600 aa30.05■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 CCDC82Q8N4S0 544 aa30.05■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 GOPCQ9HD26 462 aa30.05■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 FAM184AQ8NB25 1140 aa30.04■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 GMCL1Q96IK5 515 aa30.04■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 LZTS2Q9BRK4 669 aa30.04■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 WDR18Q9BV38 432 aa30.04■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 SLC26A6Q9BXS9 759 aa30.04■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 AS3MTQ9HBK9 375 aa30.04■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa30.03■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 KLRF2D3W0D1 207 aa30.03■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 RAD21O60216 631 aa30.03■■■□□ 2.4
SOBP-202ENST00000477448 GTF2A2P52657 109 aa30.03■■■□□ 2.4
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