RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.34■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.34■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.34■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 IQCA1Q86XH1 822 aa22.34■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 INCENPQ9NQS7 918 aa22.34■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 FEM1BQ9UK73 627 aa22.34■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 A0A0G2JMZ2 1700 aa22.34■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 RLFQ13129 1914 aa22.33■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 HTTP42858 3142 aa22.33■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 RAD21O60216 631 aa22.33■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 PLA2G6O60733 806 aa22.33■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 TOP1P11387 765 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 GRK4P32298 578 aa22.33■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 SLFN13Q68D06 897 aa22.33■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 ZNF333Q96JL9 665 aa22.33■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.33■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 SLF1Q9BQI6 1058 aa22.33■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 SPATC1LQ9H0A9 340 aa22.33■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 BTBD7Q9P203 1132 aa22.33■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 BMP3P12645 472 aa22.32■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.32■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 PLEKHH3Q7Z736 793 aa22.32■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 DGKHQ86XP1 1220 aa22.32■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 MAP4K1Q92918 833 aa22.32■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 ATG4CQ96DT6 458 aa22.32■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.32■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 GJD2Q9UKL4 321 aa22.32■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 GABRQQ9UN88 632 aa22.32■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 CAPN15O75808 1086 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 SLC25A27O95847 323 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 UBXN2AP68543 259 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 TRDNQ13061 729 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 GPR142Q7Z601 462 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 FAM160B2Q86V87 743 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 PORCNQ9H237 461 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 MROH8Q9H579 483 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 PARP14Q460N5 1801 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 NEDD4P46934 1319 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 VWA5AO00534 786 aa22.3■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 STRNO43815 780 aa22.3■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 ADCY3O60266 1144 aa22.3■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 CDC45O75419 566 aa22.3■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 CAPN2P17655 700 aa22.3■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 SLC1A4P43007 532 aa22.3■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 RGS19P49795 217 aa22.3■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 DCAF4Q8WV16 495 aa22.3■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa22.3■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 SLC15A5A6NIM6 579 aa22.29■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 ATP2A1O14983 1001 aa22.29■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 NMT2O60551 498 aa22.29■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 STAT2P52630 851 aa22.29■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 PTH1RQ03431 593 aa22.29■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 ANKS1AQ92625 1134 aa22.29■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.29■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 DOCK3Q8IZD9 2030 aa22.29■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 PTPREP23469 700 aa22.28■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 RGS2P41220 211 aa22.28■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 OAZ1P54368 228 aa22.28■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 MORN1Q5T089 497 aa22.28■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 RIOX2Q8IUF8 465 aa22.28■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 ABRAQ8N0Z2 381 aa22.28■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 USP6NLQ92738 828 aa22.28■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.28■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.28■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 B4E1Z4 1266 aa22.27■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 ZBED4O75132 1171 aa22.27■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 KDM4AO75164 1064 aa22.27■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 CYP21A2P08686 494 aa22.27■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 GRB14Q14449 540 aa22.27■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 TMEM132BQ14DG7 1078 aa22.27■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 REPS2Q8NFH8 660 aa22.27■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SYF2-203ENST00000474160 PEX10O60683 326 aa22.26■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 HOXC6P09630 235 aa22.26■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 STAT3P40763 770 aa22.26■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 MAP2K5Q13163 448 aa22.26■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 SH3TC2Q8TF17 1288 aa22.26■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 APBA2Q99767 749 aa22.26■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.26■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.26■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa22.26■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 ZSWIM5Q9P217 1185 aa22.26■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 TMEM232C9JQI7 657 aa22.25■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 HMGCRP04035 888 aa22.25■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 ERCC3P19447 782 aa22.25■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 MCCP23508 829 aa22.25■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 PLS1Q14651 629 aa22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms