RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462694.1

PTEN-202, Transcript of phosphatase and tensin homolog, humanhuman

TSL 2

Gene PTEN, Length 383 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTEN-202ENST00000462694 FOSL1P15407 271 aa7.16□□□□□ -1.26
PTEN-202ENST00000462694 TNK2Q07912 1038 aa7.16□□□□□ -1.26
PTEN-202ENST00000462694 NBPF11Q86T75 865 aa7.16□□□□□ -1.26
PTEN-202ENST00000462694 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTEN-202ENST00000462694 KLHL25Q9H0H3 589 aa7.16□□□□□ -1.26
PTEN-202ENST00000462694 FBXL21Q9UKT6 434 aa7.16□□□□□ -1.26
PTEN-202ENST00000462694 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTEN-202ENST00000462694 SHOXO15266 292 aa7.15□□□□□ -1.26
PTEN-202ENST00000462694 ITGA4P13612 1032 aa7.15□□□□□ -1.26
PTEN-202ENST00000462694 CD247P20963 164 aa7.15□□□□□ -1.26
PTEN-202ENST00000462694 CLCN7P51798 805 aa7.15□□□□□ -1.26
PTEN-202ENST00000462694 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PTEN-202ENST00000462694 LRP8Q14114 963 aa7.15□□□□□ -1.26
PTEN-202ENST00000462694 NETO1Q8TDF5 533 aa7.15□□□□□ -1.26
PTEN-202ENST00000462694 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PTEN-202ENST00000462694 APBA2Q99767 749 aa7.15□□□□□ -1.26
PTEN-202ENST00000462694 PRDM14Q9GZV8 571 aa7.15□□□□□ -1.26
PTEN-202ENST00000462694 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PTEN-202ENST00000462694 PIF1Q9H611 641 aa7.15□□□□□ -1.26
PTEN-202ENST00000462694 GP6Q9HCN6 339 aa7.15□□□□□ -1.26
PTEN-202ENST00000462694 ZFP64Q9NPA5 681 aa7.15□□□□□ -1.26
PTEN-202ENST00000462694 WHRNQ9P202 907 aa7.15□□□□□ -1.26
PTEN-202ENST00000462694 U3KQE9 123 aa7.15□□□□□ -1.26
PTEN-202ENST00000462694 FAM221BA6H8Z2 402 aa7.14□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 NKPD1Q17RQ9 610 aa7.14□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 SPACA3Q8IXA5 215 aa7.14□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 GPR62Q9BZJ7 368 aa7.14□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 SUSD2Q9UGT4 822 aa7.14□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa7.14□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 A0A087WZG4 1122 aa7.13□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 PPM1BO75688 479 aa7.13□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 MED26O95402 600 aa7.13□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa7.13□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 SLC10A6Q3KNW5 377 aa7.13□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 MTERF2Q49AM1 385 aa7.13□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 SNX11Q9Y5W9 270 aa7.13□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 ST14Q9Y5Y6 855 aa7.13□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 FHOD1Q9Y613 1164 aa7.13□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 TMEM265A0A087WTH1 108 aa7.12□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 IQCA1LA6NCM1 817 aa7.12□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 AGRPO00253 132 aa7.12□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 SIGLEC6O43699 453 aa7.12□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 CD97P48960 835 aa7.12□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 SV2CQ496J9 727 aa7.12□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 ARTNQ5T4W7 220 aa7.12□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 TMC3Q7Z5M5 1100 aa7.12□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 THAP5Q7Z6K1 395 aa7.12□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 FGD4Q96M96 766 aa7.12□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 GPATCH2Q9NW75 528 aa7.12□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 GFOD1Q9NXC2 390 aa7.12□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 PLAGL2Q9UPG8 496 aa7.12□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa7.12□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 PRAMEF1O95521 474 aa7.11□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 SRFP11831 508 aa7.11□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 ZNF445P59923 1031 aa7.11□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 CDKAL1Q5VV42 579 aa7.11□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 Q8N3U1 123 aa7.11□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 DSCC1Q9BVC3 393 aa7.11□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 HDAC8Q9BY41 377 aa7.11□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 CHST7Q9NS84 486 aa7.11□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 APEX2Q9UBZ4 518 aa7.11□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 SHISA3A0PJX4 238 aa7.1□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 H3BS24 57 aa7.1□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 MSMPQ1L6U9 139 aa7.1□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 POMZP3Q6PJE2 187 aa7.1□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 FIBCD1Q8N539 461 aa7.1□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 DAGLBQ8NCG7 672 aa7.1□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 FLCNQ8NFG4 579 aa7.1□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 PPP1R14AQ96A00 147 aa7.1□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 SGSM3Q96HU1 749 aa7.1□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 HSPA12BQ96MM6 686 aa7.1□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 DNAJC7Q99615 494 aa7.1□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 LRP2BPQ9P2M1 347 aa7.1□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 ZMYM5Q9UJ78 669 aa7.1□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa7.09□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa7.09□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 NOP56O00567 594 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 WNT11O96014 354 aa7.09□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 SPATC1Q76KD6 591 aa7.09□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PTEN-202ENST00000462694 TP53INP2Q8IXH6 220 aa7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.1 ms