RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461448.5

SNHG12-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 12, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG12, Length 1,629 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12-201ENST00000461448 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.84■■□□□ 1.25
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SNHG12-201ENST00000461448 BMP3P12645 472 aa22.83■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 EVCP57679 992 aa22.83■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.83■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22.83■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa22.83■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 IFNL1Q8IU54 200 aa22.83■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.83■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 NUP133Q8WUM0 1156 aa22.83■■□□□ 1.25
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SNHG12-201ENST00000461448 MYL10Q9BUA6 226 aa22.83■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.83■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa22.83■■□□□ 1.25
SNHG12-201ENST00000461448 USP17L15C9J2P7 530 aa22.82■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.82■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 USP17L11C9JVI0 530 aa22.82■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 USP17L18D6R9N7 530 aa22.82■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 USP17L22D6RA61 530 aa22.82■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.82■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 USP17L19D6RCP7 530 aa22.82■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 USP17L20D6RJB6 530 aa22.82■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 PDHXO00330 501 aa22.82■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 PDHBP11177 359 aa22.82■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 RCAN1P53805 252 aa22.82■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 USP17L24Q0WX57 530 aa22.82■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 KCTD1Q719H9 257 aa22.82■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 DDAH1O94760 285 aa22.82■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa22.82■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 SNX21Q969T3 373 aa22.82■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.82■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 PTPRFP10586 1907 aa22.81■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 ZBTB43O43298 467 aa22.81■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 RXRAP19793 462 aa22.81■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 OSBPP22059 807 aa22.81■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 TROAPQ12815 778 aa22.81■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 APOA5Q6Q788 366 aa22.81■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.81■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 MAP3K14Q99558 947 aa22.81■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.81■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 TMEM232C9JQI7 657 aa22.8■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 GOLGA8HP0CJ92 632 aa22.8■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 SNHG28P0DPA3 235 aa22.8■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 PPP2R5BQ15173 497 aa22.8■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 MICU3Q86XE3 530 aa22.8■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.8■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.8■■□□□ 1.24
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SNHG12-201ENST00000461448 ZNF543Q08ER8 600 aa22.79■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 HSCBQ8IWL3 235 aa22.79■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 PNMA3Q9UL41 463 aa22.79■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa22.79■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 GOLGA8BA8MQT2 603 aa22.79■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 FLOT1O75955 427 aa22.79■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 KIF5BP33176 963 aa22.79■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 GRM4Q14833 912 aa22.79■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.79■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.79■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 FEM1BQ9UK73 627 aa22.79■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa22.78■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 BECN1Q14457 450 aa22.78■■□□□ 1.24
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SNHG12-201ENST00000461448 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.78■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.78■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 GOLGA8AA7E2F4 631 aa22.77■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 ALDH1A1P00352 501 aa22.77■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 CYP2C8P10632 490 aa22.77■■□□□ 1.24
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SNHG12-201ENST00000461448 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP22.77■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 STAT2P52630 851 aa22.77■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 COG2Q14746 738 aa22.77■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 STAG2Q8N3U4 1231 aa22.77■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 FANCBQ8NB91 859 aa22.77■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.77■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 MAD2L2Q9UI95 211 aa22.77■■□□□ 1.24
SNHG12-201ENST00000461448 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 SLC16A2P36021 539 aa22.76■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 FAM160B2Q86V87 743 aa22.76■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 KIFC2Q96AC6 838 aa22.76■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 SLF1Q9BQI6 1058 aa22.76■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.76■■□□□ 1.23
SNHG12-201ENST00000461448 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
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