RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa26.55■■□□□ 1.84
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FAAP20-209ENST00000428120 KRBA2Q6ZNG9 492 aa26.55■■□□□ 1.84
FAAP20-209ENST00000428120 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
FAAP20-209ENST00000428120 TTLL6Q8N841 843 aa26.55■■□□□ 1.84
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
FAAP20-209ENST00000428120 UBA5Q9GZZ9 404 aa26.55■■□□□ 1.84
FAAP20-209ENST00000428120 CLIP2Q9UDT6 1046 aa26.55■■□□□ 1.84
FAAP20-209ENST00000428120 PCDHA4Q9UN74 947 aa26.55■■□□□ 1.84
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
FAAP20-209ENST00000428120 FOXN1O15353 648 aa26.54■■□□□ 1.84
FAAP20-209ENST00000428120 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
FAAP20-209ENST00000428120 CALML3P27482 149 aa26.54■■□□□ 1.84
FAAP20-209ENST00000428120 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
FAAP20-209ENST00000428120 LZTS2Q9BRK4 669 aa26.54■■□□□ 1.84
FAAP20-209ENST00000428120 SH3GLB2Q9NR46 395 aa26.54■■□□□ 1.84
FAAP20-209ENST00000428120 FAM198AQ9UFP1 575 aa26.54■■□□□ 1.84
FAAP20-209ENST00000428120 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
FAAP20-209ENST00000428120 BECN2A8MW95 431 aa26.54■■□□□ 1.84
FAAP20-209ENST00000428120 STXBP3O00186 592 aa26.54■■□□□ 1.84
FAAP20-209ENST00000428120 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa26.54■■□□□ 1.84
FAAP20-209ENST00000428120 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
FAAP20-209ENST00000428120 SPZ1Q9BXG8 430 aa26.54■■□□□ 1.84
FAAP20-209ENST00000428120 DNAJC18Q9H819 358 aa26.54■■□□□ 1.84
FAAP20-209ENST00000428120 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa26.54■■□□□ 1.84
FAAP20-209ENST00000428120 PDHBP11177 359 aa26.53■■□□□ 1.84
FAAP20-209ENST00000428120 DPEP1P16444 411 aa26.53■■□□□ 1.84
FAAP20-209ENST00000428120 PTGDRQ13258 359 aa26.53■■□□□ 1.84
FAAP20-209ENST00000428120 AOPEPQ8N6M6 819 aa26.53■■□□□ 1.84
FAAP20-209ENST00000428120 TRIM5Q9C035 493 aa26.53■■□□□ 1.84
FAAP20-209ENST00000428120 BARHL2Q9NY43 387 aa26.53■■□□□ 1.84
FAAP20-209ENST00000428120 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa26.53■■□□□ 1.84
FAAP20-209ENST00000428120 MCM7P33993 719 aa26.53■■□□□ 1.84
FAAP20-209ENST00000428120 ATP2B2Q01814 1243 aa26.53■■□□□ 1.84
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
FAAP20-209ENST00000428120 SUPT20HQ8NEM7 779 aa26.53■■□□□ 1.84
FAAP20-209ENST00000428120 MRIQ9BWK5 157 aa26.53■■□□□ 1.84
FAAP20-209ENST00000428120 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
FAAP20-209ENST00000428120 SERPINA10Q9UK55 444 aa26.52■■□□□ 1.84
FAAP20-209ENST00000428120 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP26.52■■□□□ 1.849e-11■□□□□ 10.8
FAAP20-209ENST00000428120 EPSTI1Q96J88 318 aa26.51■■□□□ 1.84
FAAP20-209ENST00000428120 PIGSQ96S52 555 aa26.51■■□□□ 1.84
FAAP20-209ENST00000428120 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.84
FAAP20-209ENST00000428120 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.84
FAAP20-209ENST00000428120 TTLL1O95922 423 aa26.51■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa26.51■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 SERTAD1Q9UHV2 236 aa26.51■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC93Q567U6 631 aa26.5■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC148Q8NFR7 591 aa26.5■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 VWA3AA6NCI4 1184 aa26.5■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 KCNA3P22001 575 aa26.5■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 NAPAP54920 295 aa26.5■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 NLRP12P59046 1061 aa26.5■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 PCDHA6Q9UN73 950 aa26.5■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa26.5■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 CFAP100Q494V2 611 aa26.49■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa26.49■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 IDI2Q9BXS1 227 aa26.49■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 GPCPD1Q9NPB8 672 aa26.49■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 TUBE1Q9UJT0 475 aa26.49■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 RAD17O75943 681 aa26.49■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 BMP15O95972 392 aa26.49■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF75DP51815 510 aa26.49■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 EHD4Q9H223 541 aa26.49■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa26.48■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 M0R2N6 131 aa26.48■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 TRAPPC10P48553 1259 aa26.48■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 MYO3BQ8WXR4 1341 aa26.48■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 A0A087X0B3 334 aa26.48■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 PLA2G4DQ86XP0 818 aa26.48■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 LARGE2Q8N3Y3 721 aa26.48■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 FERMT2Q96AC1 680 aa26.48■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa26.48■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 SIPA1L1O43166 1804 aa26.47■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 PRR29P0C7W0 189 aa26.47■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 PI4KBQ9UBF8 816 aa26.47■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 INF2Q27J81 1249 aa26.47■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 RTKN2Q8IZC4 609 aa26.47■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 DHX58Q96C10 678 aa26.47■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 ZBTB7AO95365 584 aa26.46■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 RAD21O60216 631 aa26.45■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 POSTNQ15063 836 aa26.45■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 ASPRV1Q53RT3 343 aa26.45■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 DRC7Q8IY82 874 aa26.45■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 DAGLBQ8NCG7 672 aa26.45■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 FBXO41Q8TF61 875 aa26.45■■□□□ 1.83
FAAP20-209ENST00000428120 TRIM34Q9BYJ4 488 aa26.45■■□□□ 1.83
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