RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 FUT2Q10981 343 aa19.68■□□□□ 0.74
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ELP3Q9H9T3 547 aa19.68■□□□□ 0.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
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TOP3BP1-201ENST00000420768 PPFIA3O75145 1194 aa19.62■□□□□ 0.73
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TOP3BP1-201ENST00000420768 IKQ13123 557 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
TOP3BP1-201ENST00000420768 TTBK2Q6IQ55 1244 aa19.61■□□□□ 0.73
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADGRF4Q8IZF3 695 aa19.61■□□□□ 0.73
TOP3BP1-201ENST00000420768 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC35G1Q2M3R5 365 aa19.6■□□□□ 0.73
TOP3BP1-201ENST00000420768 SYDE2Q5VT97 1194 aa19.6■□□□□ 0.73
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
TOP3BP1-201ENST00000420768 ALG1Q9BT22 464 aa19.6■□□□□ 0.73
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHMP5Q9NZZ3 219 aa19.6■□□□□ 0.73
TOP3BP1-201ENST00000420768 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
TOP3BP1-201ENST00000420768 XBP1P17861 261 aa19.59■□□□□ 0.73
TOP3BP1-201ENST00000420768 SYT1P21579 422 aa19.59■□□□□ 0.73
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC16A2P36021 539 aa19.59■□□□□ 0.73
TOP3BP1-201ENST00000420768 NUCB2P80303 420 aa19.59■□□□□ 0.73
TOP3BP1-201ENST00000420768 SNAPC2Q13487 334 aa19.59■□□□□ 0.73
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