RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410938.1

RNU6-1328P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1328, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1328P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ANO1Q5XXA6 986 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SLC6A19Q695T7 634 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 NXNQ6DKJ4 435 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PKN3Q6P5Z2 889 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PGM2L1Q6PCE3 622 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 USP53Q70EK8 1073 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 BRAPQ7Z569 592 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 VN1R5Q7Z5H4 357 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 FCHSD1Q86WN1 690 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 HID1Q8IV36 788 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TRIM22Q8IYM9 498 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CPXCR1Q8N123 301 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 IL22RA1Q8N6P7 574 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MAGEB6Q8N7X4 407 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 DCAF11Q8TEB1 546 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 FBXO41Q8TF61 875 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 KLHL6Q8WZ60 621 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 LRGUKQ96M69 825 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 DSCC1Q9BVC3 393 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZHX3Q9H4I2 956 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PIDD1Q9HB75 910 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MAN1C1Q9NR34 630 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 STRN4Q9NRL3 753 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TOR4AQ9NXH8 423 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SAMD15Q9P1V8 674 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 WHRNQ9P202 907 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TRIM33Q9UPN9 1127 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 GIT1Q9Y2X7 761 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RASSF10A6NK89 507 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZBTB42B2RXF5 422 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RGS13O14921 159 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ERC2O15083 957 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 GSTA4O15217 222 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 XPOTO43592 962 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RFPL1O75677 317 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 KCNH1O95259 989 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CPP00450 1065 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PF4V1P10720 104 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 LIG1P18858 919 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CD53P19397 219 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 HOXC12P31275 282 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ECI1P42126 302 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ST5P78524 1137 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SETQ01105 290 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MORC3Q14149 939 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PPP2R5DQ14738 602 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ACAP2Q15057 778 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 NBPF9Q3BBW0 867 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 FAM182BQ5T319 152 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CCDC70Q6NSX1 233 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 C1orf228Q6PIY5 440 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZNF227Q86WZ6 799 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 IFNL3Q8IZI9 196 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ADCY4Q8NFM4 1077 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SVIPQ8NHG7 77 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 WNT8BQ93098 351 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 E2F7Q96AV8 911 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TMEM87BQ96K49 555 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ALG1Q9BT22 464 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 WNT10AQ9GZT5 417 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 OSGEPQ9NPF4 335 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MKS1Q9NXB0 559 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 OBP2AQ9NY56 170 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SWAP70Q9UH65 585 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SLC6A14Q9UN76 642 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 FAM50BQ9Y247 325 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CDC14CA4D256 554 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1328P-201ENST00000410938 FAM187AA6NFU0 413 aa3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms