RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409937.1

CNGA3-204, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CNGA3, Length 2,615 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-204ENST00000409937 SIK1P57059 783 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 PIP4K2BP78356 416 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 MCM6Q14566 821 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 LONRF2Q1L5Z9 754 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 PDXDC2PQ6P474 469 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 ANAPC4Q9UJX5 808 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 TXLNAP40222 546 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 PMS1P54277 932 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 FILIP1LQ4L180 1135 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 GSDMAQ96QA5 445 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 BRMS1Q9HCU9 246 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 KCNQ2O43526 872 aa15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 MECOMQ03112 1051 aa15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 NCAPH2Q6IBW4 605 aa15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 STAG2Q8N3U4 1231 aa15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 RABGGTAQ92696 567 aa15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 FERMT2Q96AC1 680 aa15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 CPVLQ9H3G5 476 aa15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 ABHD10Q9NUJ1 306 aa15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF804BA4D1E1 1349 aa15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 KCNJ18B7U540 433 aa15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 ADAMTS2O95450 1211 aa15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 PRCPP42785 496 aa15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 COPB1P53618 953 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 KCNJ12Q14500 433 aa15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 TYW1BQ6NUM6 668 aa15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 ENC1O14682 589 aa15.91■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 USP17L8P0C7I0 530 aa15.91■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 SCG2P13521 617 aa15.91■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 PAK1Q13153 545 aa15.91■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 DYNLL2Q96FJ2 89 aa15.91■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 MINPP1Q9UNW1 487 aa15.91■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 TPM1P09493 284 aa15.91■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 IQUBQ8NA54 791 aa15.91■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 RASSF8Q8NHQ8 419 aa15.91■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 HDAC6Q9UBN7 1215 aa15.91■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 A0A1B0GUL6 1792 aa15.9■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 TSPY2A6NKD2 308 aa15.9■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 KRT9P35527 623 aa15.9■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 ARHGAP25P42331 645 aa15.9■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 UBXN1Q04323 297 aa15.9■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 LRRC15Q8TF66 581 aa15.9■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 AK7Q96M32 723 aa15.9■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 CDC23Q9UJX2 597 aa15.9■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 RPN1P04843 607 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 RCAN1P53805 252 aa15.9■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 PARP10Q53GL7 1025 aa15.9■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 CAVIN4Q5BKX8 364 aa15.9■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 TCP11X2Q5H9J9 407 aa15.9■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 TXNRD3Q86VQ6 643 aa15.9■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 UBXN6Q9BZV1 441 aa15.9■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 TMEM60Q9H2L4 133 aa15.9■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 PDE11AQ9HCR9 933 aa15.9■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 GUCA1BQ9UMX6 200 aa15.9■□□□□ 0.14
CNGA3-204ENST00000409937 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-204ENST00000409937 KLK7P49862 253 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-204ENST00000409937 VSNL1P62760 191 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-204ENST00000409937 CNGA4Q8IV77 575 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-204ENST00000409937 BRIP1Q9BX63 1249 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-204ENST00000409937 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-204ENST00000409937 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-204ENST00000409937 CTAGE9A4FU28 777 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-204ENST00000409937 STAT6P42226 847 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-204ENST00000409937 IRF2BP1Q8IU81 584 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-204ENST00000409937 SLC44A5Q8NCS7 719 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-204ENST00000409937 CTAGE1Q96RT6 745 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-204ENST00000409937 ABCB6Q9NP58 842 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-204ENST00000409937 CCDC66A2RUB6 948 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-204ENST00000409937 SRGAP2O75044 1071 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-204ENST00000409937 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-204ENST00000409937 RCSD1Q6JBY9 416 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-204ENST00000409937 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-204ENST00000409937 HINFPQ9BQA5 517 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-204ENST00000409937 MTA3Q9BTC8 594 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-204ENST00000409937 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-204ENST00000409937 TTC26A0AVF1 554 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-204ENST00000409937 USP17L3A6NCW0 530 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-204ENST00000409937 USP17L4A6NCW7 530 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-204ENST00000409937 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-204ENST00000409937 DDAH1O94760 285 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-204ENST00000409937 GOLGA8HP0CJ92 632 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-204ENST00000409937 SLC35G1Q2M3R5 365 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-204ENST00000409937 USP17L1Q7RTZ2 530 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-204ENST00000409937 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-204ENST00000409937 MCM9Q9NXL9 1143 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-204ENST00000409937 RWDD2AQ9UIY3 292 aa15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.9 ms