RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394272.7

HDDC3-202, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HDDC3, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-202ENST00000394272 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP23.45■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 MYSM1Q5VVJ2 828 aa23.45■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa23.45■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 RIOX1Q9H6W3 641 aa23.45■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 SOCS7O14512 581 aa23.44■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 GPT2Q8TD30 523 aa23.44■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 PIBF1Q8WXW3 757 aa23.44■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 A0A1W2PRG0 241 aa23.43■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 BTBD18B2RXH4 712 aa23.43■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 DCAF4Q8WV16 495 aa23.43■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 USP28Q96RU2 1077 aa23.43■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa23.43■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 NPY5RQ15761 445 aa23.43■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 SLFN13Q68D06 897 aa23.43■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 DPY19L2Q6NUT2 758 aa23.43■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 UBA5Q9GZZ9 404 aa23.43■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 SH3GLB2Q9NR46 395 aa23.43■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa23.43■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 F5H6K3 240 aa23.42■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 KLRC3Q07444 240 aa23.42■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 SPATA32Q96LK8 384 aa23.42■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 GPCPD1Q9NPB8 672 aa23.42■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 ASNSP08243 561 aa23.41■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 NOSTRINQ8IVI9 506 aa23.41■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa23.41■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 MBD3O95983 291 aa23.41■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 UBE2HP62256 183 aa23.41■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 CCDC96Q2M329 555 aa23.41■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 KCTD1Q719H9 257 aa23.41■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 OXER1Q8TDS5 423 aa23.41■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 GMCL1Q96IK5 515 aa23.41■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 RCOR1Q9UKL0 485 aa23.41■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 TMX2Q9Y320 296 aa23.41■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 NDUFB10O96000 172 aa23.4■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 ECE1P42892 770 aa23.4■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 SLC1A4P43007 532 aa23.4■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 NR5A1Q13285 461 aa23.4■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 WWC2Q6AWC2 1192 aa23.4■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 TTBK2Q6IQ55 1244 aa23.4■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 TYW1BQ6NUM6 668 aa23.4■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 ACER1Q8TDN7 264 aa23.4■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 BARHL2Q9NY43 387 aa23.4■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 KRT2P35908 639 aa23.39■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 DCAF15Q66K64 600 aa23.39■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 HOOK2Q96ED9 719 aa23.39■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 PIGSQ96S52 555 aa23.39■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 GINM1Q9NU53 330 aa23.39■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 POLR3EQ9NVU0 708 aa23.39■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 RTEL1Q9NZ71 1219 aa23.39■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
HDDC3-202ENST00000394272 VAT1LQ9HCJ6 419 aa23.39■■□□□ 1.33
HDDC3-202ENST00000394272 DOCK1Q14185 1865 aa23.38■■□□□ 1.33
HDDC3-202ENST00000394272 STXBP3O00186 592 aa23.38■■□□□ 1.33
HDDC3-202ENST00000394272 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
HDDC3-202ENST00000394272 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
HDDC3-202ENST00000394272 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa23.38■■□□□ 1.33
HDDC3-202ENST00000394272 HOMER1Q86YM7 354 aa23.38■■□□□ 1.33
HDDC3-202ENST00000394272 ADGRF4Q8IZF3 695 aa23.38■■□□□ 1.33
HDDC3-202ENST00000394272 TNFRSF25Q93038 417 aa23.38■■□□□ 1.33
HDDC3-202ENST00000394272 MTMR8Q96EF0 704 aa23.38■■□□□ 1.33
HDDC3-202ENST00000394272 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF112Q9UJU3 913 aa23.38■■□□□ 1.33
HDDC3-202ENST00000394272 SCN4AP35499 1836 aa23.37■■□□□ 1.33
HDDC3-202ENST00000394272 SSC5DA1L4H1 1573 aa23.37■■□□□ 1.33
HDDC3-202ENST00000394272 GLTPD2A6NH11 291 aa23.37■■□□□ 1.33
HDDC3-202ENST00000394272 NASPP49321 788 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
HDDC3-202ENST00000394272 NLRP5P59047 1200 aa23.37■■□□□ 1.33
HDDC3-202ENST00000394272 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa23.37■■□□□ 1.33
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF341Q9BYN7 854 aa23.37■■□□□ 1.33
HDDC3-202ENST00000394272 JMJD4Q9H9V9 463 aa23.37■■□□□ 1.33
HDDC3-202ENST00000394272 BRMS1Q9HCU9 246 aa23.37■■□□□ 1.33
HDDC3-202ENST00000394272 RAD21O60216 631 aa23.36■■□□□ 1.33
HDDC3-202ENST00000394272 CCDC148Q8NFR7 591 aa23.36■■□□□ 1.33
HDDC3-202ENST00000394272 CLIC4Q9Y696 253 aa23.36■■□□□ 1.33
HDDC3-202ENST00000394272 CALML3P27482 149 aa23.36■■□□□ 1.33
HDDC3-202ENST00000394272 SLC16A2P36021 539 aa23.36■■□□□ 1.33
HDDC3-202ENST00000394272 ANO1Q5XXA6 986 aa23.36■■□□□ 1.33
HDDC3-202ENST00000394272 LINC00301Q8NCQ3 95 aa23.36■■□□□ 1.33
HDDC3-202ENST00000394272 hCG_1984214I3L0E3 225 aa23.35■■□□□ 1.33
HDDC3-202ENST00000394272 YEATS4O95619 227 aa23.35■■□□□ 1.33
HDDC3-202ENST00000394272 BMP3P12645 472 aa23.35■■□□□ 1.33
HDDC3-202ENST00000394272 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa23.35■■□□□ 1.33
HDDC3-202ENST00000394272 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
HDDC3-202ENST00000394272 PGBD1Q96JS3 809 aa23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms