RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CCL20-201ENST00000358813 RUSC1Q9BVN2 902 aa7.42□□□□□ -1.22
CCL20-201ENST00000358813 TMEM39AQ9NV64 488 aa7.42□□□□□ -1.22
CCL20-201ENST00000358813 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa7.42□□□□□ -1.22
CCL20-201ENST00000358813 BPNT1O95861 308 aa7.41□□□□□ -1.22
CCL20-201ENST00000358813 CYP11A1P05108 521 aa7.41□□□□□ -1.22
CCL20-201ENST00000358813 FURINP09958 794 aa7.41□□□□□ -1.22
CCL20-201ENST00000358813 MASP1P48740 699 aa7.41□□□□□ -1.22
CCL20-201ENST00000358813 C2orf27AQ580R0 203 aa7.41□□□□□ -1.22
CCL20-201ENST00000358813 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CCL20-201ENST00000358813 SYNPOQ8N3V7 929 aa7.41□□□□□ -1.22
CCL20-201ENST00000358813 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
CCL20-201ENST00000358813 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
CCL20-201ENST00000358813 MEGF10Q96KG7 1140 aa7.41□□□□□ -1.22
CCL20-201ENST00000358813 ZNRF3Q9ULT6 936 aa7.41□□□□□ -1.22
CCL20-201ENST00000358813 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa7.41□□□□□ -1.22
CCL20-201ENST00000358813 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa7.41□□□□□ -1.22
CCL20-201ENST00000358813 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa7.4□□□□□ -1.22
CCL20-201ENST00000358813 FAM221AA4D161 298 aa7.4□□□□□ -1.22
CCL20-201ENST00000358813 PAGE1O75459 146 aa7.4□□□□□ -1.22
CCL20-201ENST00000358813 CASP7P55210 303 aa7.4□□□□□ -1.22
CCL20-201ENST00000358813 FAAP100Q0VG06 881 aa7.4□□□□□ -1.22
CCL20-201ENST00000358813 SQSTM1Q13501 440 aa7.4□□□□□ -1.22
CCL20-201ENST00000358813 LRRC14Q15048 493 aa7.4□□□□□ -1.22
CCL20-201ENST00000358813 TCEA2Q15560 299 aa7.4□□□□□ -1.22
CCL20-201ENST00000358813 GK5Q6ZS86 529 aa7.4□□□□□ -1.22
CCL20-201ENST00000358813 CORO1BQ9BR76 489 aa7.4□□□□□ -1.22
CCL20-201ENST00000358813 CEP41Q9BYV8 373 aa7.4□□□□□ -1.22
CCL20-201ENST00000358813 RNF208Q9H0X6 261 aa7.4□□□□□ -1.22
CCL20-201ENST00000358813 BRMS1Q9HCU9 246 aa7.4□□□□□ -1.22
CCL20-201ENST00000358813 CYP8B1Q9UNU6 501 aa7.4□□□□□ -1.22
CCL20-201ENST00000358813 LEMD3Q9Y2U8 911 aa7.4□□□□□ -1.22
CCL20-201ENST00000358813 RIMS2Q9UQ26 1411 aa7.4□□□□□ -1.22
CCL20-201ENST00000358813 NWD1Q149M9 1564 aa7.4□□□□□ -1.22
CCL20-201ENST00000358813 LRP6O75581 1613 aa7.4□□□□□ -1.22
CCL20-201ENST00000358813 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CCL20-201ENST00000358813 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 MAOBP27338 520 aa7.39□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 AP3B2Q13367 1082 aa7.39□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 SEPT6Q14141 434 aa7.39□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 POU4F3Q15319 338 aa7.39□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 Q6ZS46 218 aa7.39□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 REC114Q7Z4M0 266 aa7.39□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa7.39□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 SHPRHQ149N8 1683 aa7.38□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 MROH1Q8NDA8 1641 aa7.38□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 KDM2BQ8NHM5 1336 aa7.38□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 MEGF11A6BM72 1044 aa7.38□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 CILPO75339 1184 aa7.38□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 DDAH1O94760 285 aa7.38□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 PDGFRBP09619 1106 aa7.38□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 PPP2R5EQ16537 467 aa7.38□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 NUTM2GQ5VZR2 741 aa7.38□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 ANKRD34AQ69YU3 496 aa7.38□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 FDX2Q6P4F2 183 aa7.38□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 JMYQ8N9B5 988 aa7.38□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 STAG1Q8WVM7 1258 aa7.38□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 NRSN2Q9GZP1 204 aa7.38□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 TRPM2O94759 1503 aa7.37□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 RGS12O14924 1447 aa7.37□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 PIK3R4Q99570 1358 aa7.37□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 SART1O43290 800 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 GJB6O95452 261 aa7.37□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 DLGAP3O95886 979 aa7.37□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 VIL1P09327 827 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 NME2P22392 152 aa7.37□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 CLCQ05315 142 aa7.37□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 BRINP3Q76B58 766 aa7.37□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 KRT26Q7Z3Y9 468 aa7.37□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 CEP89Q96ST8 783 aa7.37□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 PSMD1Q99460 953 aa7.37□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa7.37□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa7.37□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 TNKS2Q9H2K2 1166 aa7.37□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 CYP4F12Q9HCS2 524 aa7.37□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 PLAAQ9Y263 795 aa7.37□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 FAN1Q9Y2M0 1017 aa7.37□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 DIP2AQ14689 1571 aa7.37□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 DAPK1P53355 1430 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 VPS8Q8N3P4 1428 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 BMP6P22004 513 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-201ENST00000358813 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 131.9 ms