RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa32.4■■■□□ 2.78
GIPC1-201ENST00000345425 HPS5Q9UPZ3 1129 aa32.4■■■□□ 2.78
GIPC1-201ENST00000345425 LOC285556D6RIA3 1793 aa32.39■■■□□ 2.78
GIPC1-201ENST00000345425 BMP3P12645 472 aa32.39■■■□□ 2.78
GIPC1-201ENST00000345425 VCAM1P19320 739 aa32.39■■■□□ 2.78
GIPC1-201ENST00000345425 ME3Q16798 604 aa32.39■■■□□ 2.78
GIPC1-201ENST00000345425 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP32.39■■■□□ 2.78
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa32.38■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF543Q08ER8 600 aa32.38■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 STK3Q13188 491 aa32.38■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 DGKZQ13574 1117 aa32.38■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 RTN1Q16799 776 aa32.38■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 GADL1Q6ZQY3 521 aa32.38■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 HSCBQ8IWL3 235 aa32.38■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa32.38■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 CHMP4CQ96CF2 233 aa32.38■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 MS4A4AQ96JQ5 239 aa32.38■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP32.38■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP32.37■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 PFKFB2O60825 505 aa32.37■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 RASGRP2Q7LDG7 609 aa32.37■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 C1QTNF8P60827 252 aa32.37■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 FAM83BQ5T0W9 1011 aa32.37■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 MAD2L2Q9UI95 211 aa32.37■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP32.36■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 GNAQP50148 359 aa32.36■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 CYP4F22Q6NT55 531 aa32.36■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP32.36■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP32.36■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa32.35■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP32.35■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 LARGE1O95461 756 aa32.35■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 CCT2P78371 535 aaKnown RBP32.35■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 CCL15Q16663 113 aa32.35■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 KCTD1Q719H9 257 aa32.35■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 TMX3Q96JJ7 454 aa32.35■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP32.35■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP32.34■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 GOLGA8HP0CJ92 632 aa32.34■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 GTF3C6Q969F1 213 aa32.34■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa32.34■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 SCRN1Q12765 414 aa32.33■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 MOGSQ13724 837 aa32.33■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 STAG2Q8N3U4 1231 aa32.33■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 CAPNS2Q96L46 248 aa32.33■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 LZTS2Q9BRK4 669 aa32.33■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 TANGO6Q9C0B7 1094 aa32.33■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 GPCPD1Q9NPB8 672 aa32.33■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 KLRF2D3W0D1 207 aa32.32■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 NOGQ13253 232 aa32.32■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 GRM1Q13255 1194 aa32.32■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP32.32■■■□□ 2.772e-7■■□□□ 12
GIPC1-201ENST00000345425 FEM1BQ9UK73 627 aa32.32■■■□□ 2.77
GIPC1-201ENST00000345425 USP17L15C9J2P7 530 aa32.32■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 USP17L13C9JLJ4 530 aa32.32■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM232C9JQI7 657 aa32.32■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 USP17L11C9JVI0 530 aa32.32■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 USP17L18D6R9N7 530 aa32.32■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 USP17L22D6RA61 530 aa32.32■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 USP17L17D6RBQ6 530 aa32.32■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 USP17L19D6RCP7 530 aa32.32■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 USP17L20D6RJB6 530 aa32.32■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 HSPA6P17066 643 aa32.32■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 CDC27P30260 824 aa32.32■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 STAT2P52630 851 aa32.32■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 INHBEP58166 350 aa32.32■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 USP17L24Q0WX57 530 aa32.32■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 CHURC1Q8WUH1 139 aa32.32■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 BRI3BPQ8WY22 251 aa32.32■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP32.32■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP32.31■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 CPLX1O14810 134 aa32.31■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 PLA2G6O60733 806 aa32.31■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 IKQ13123 557 aaPredicted RBP32.31■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 TREML2Q5T2D2 321 aa32.31■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP32.31■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 FAM160B2Q86V87 743 aa32.31■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 NECAB1Q8N987 351 aa32.31■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP32.3■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 ADD1P35611 737 aaKnown RBP32.3■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 SREBF2Q12772 1141 aa32.3■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 BECN1Q14457 450 aa32.3■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 TMTC3Q6ZXV5 915 aa32.3■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa32.3■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 TTBK2Q6IQ55 1244 aa32.29■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 GPAT2Q6NUI2 795 aa32.29■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 BTNL9Q6UXG8 535 aa32.29■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 ANKRD23Q86SG2 305 aa32.29■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa32.29■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 FLOT1O75955 427 aa32.28■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 SMARCA1P28370 1054 aa32.28■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC83Q8IWF9 413 aa32.28■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 CDKL5O76039 1030 aa32.27■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 PLEKHA8P1O95397 391 aa32.27■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 HTRA3P83110 453 aa32.27■■■□□ 2.76
GIPC1-201ENST00000345425 SLF1Q9BQI6 1058 aa32.27■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms