RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
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CLN8-201ENST00000331222 DENND2CQ68D51 928 aa11.66□□□□□ -0.54
CLN8-201ENST00000331222 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
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CLN8-201ENST00000331222 ABI1Q8IZP0 508 aa11.66□□□□□ -0.54
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CLN8-201ENST00000331222 VCX3BQ9H321 246 aa11.66□□□□□ -0.54
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CLN8-201ENST00000331222 NAA35Q5VZE5 725 aa11.65□□□□□ -0.54
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CLN8-201ENST00000331222 DCAF5Q96JK2 942 aa11.65□□□□□ -0.54
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CLN8-201ENST00000331222 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa11.65□□□□□ -0.54
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CLN8-201ENST00000331222 LINS1Q8NG48 757 aa11.65□□□□□ -0.54
CLN8-201ENST00000331222 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa11.65□□□□□ -0.54
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CLN8-201ENST00000331222 OSTNP61366 133 aa11.65□□□□□ -0.55
CLN8-201ENST00000331222 CCDC13Q8IYE1 715 aa11.65□□□□□ -0.55
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CLN8-201ENST00000331222 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
CLN8-201ENST00000331222 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa11.65□□□□□ -0.55
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CLN8-201ENST00000331222 SPDL1Q96EA4 605 aa11.64□□□□□ -0.55
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CLN8-201ENST00000331222 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
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CLN8-201ENST00000331222 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa11.64□□□□□ -0.55
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CLN8-201ENST00000331222 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa11.64□□□□□ -0.55
CLN8-201ENST00000331222 NDUFAB1O14561 156 aa11.64□□□□□ -0.55
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CLN8-201ENST00000331222 MUM1L1Q5H9M0 696 aa11.64□□□□□ -0.55
CLN8-201ENST00000331222 JADE1Q6IE81 842 aa11.64□□□□□ -0.55
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CLN8-201ENST00000331222 KCTD1Q719H9 257 aa11.63□□□□□ -0.55
CLN8-201ENST00000331222 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CLN8-201ENST00000331222 ATP2A3Q93084 1043 aa11.63□□□□□ -0.55
CLN8-201ENST00000331222 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa11.63□□□□□ -0.55
CLN8-201ENST00000331222 KCNK3O14649 394 aa11.63□□□□□ -0.55
CLN8-201ENST00000331222 TRIM37O94972 964 aa11.63□□□□□ -0.55
CLN8-201ENST00000331222 PTPN21Q16825 1174 aa11.63□□□□□ -0.55
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