RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319107.8

RALGPS1-202, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 3

Gene RALGPS1, Length 770 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-202ENST00000319107 TMEM67Q5HYA8 995 aa23.69■■□□□ 1.38
RALGPS1-202ENST00000319107 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa23.69■■□□□ 1.38
RALGPS1-202ENST00000319107 C22orf23Q9BZE7 217 aa23.69■■□□□ 1.38
RALGPS1-202ENST00000319107 F5H6K3 240 aa23.68■■□□□ 1.38
RALGPS1-202ENST00000319107 NDUFB10O96000 172 aa23.68■■□□□ 1.38
RALGPS1-202ENST00000319107 RPS6KB1P23443 525 aa23.68■■□□□ 1.38
RALGPS1-202ENST00000319107 RBM25P49756 843 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
RALGPS1-202ENST00000319107 KLRC3Q07444 240 aa23.68■■□□□ 1.38
RALGPS1-202ENST00000319107 SPICE1Q8N0Z3 855 aa23.68■■□□□ 1.38
RALGPS1-202ENST00000319107 KAT14Q9H8E8 782 aa23.68■■□□□ 1.38
RALGPS1-202ENST00000319107 LY9Q9HBG7 655 aa23.68■■□□□ 1.38
RALGPS1-202ENST00000319107 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa23.68■■□□□ 1.38
RALGPS1-202ENST00000319107 PDHXO00330 501 aa23.67■■□□□ 1.38
RALGPS1-202ENST00000319107 RAD21O60216 631 aa23.67■■□□□ 1.38
RALGPS1-202ENST00000319107 CPA1P15085 419 aa23.67■■□□□ 1.38
RALGPS1-202ENST00000319107 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP23.67■■□□□ 1.38
RALGPS1-202ENST00000319107 ARHGEF6Q15052 776 aa23.67■■□□□ 1.38
RALGPS1-202ENST00000319107 PNMA1Q8ND90 353 aa23.67■■□□□ 1.38
RALGPS1-202ENST00000319107 TCEANC2Q96MN5 208 aa23.67■■□□□ 1.38
RALGPS1-202ENST00000319107 TLR2O60603 784 aa23.66■■□□□ 1.38
RALGPS1-202ENST00000319107 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
RALGPS1-202ENST00000319107 SLFN13Q68D06 897 aa23.66■■□□□ 1.38
RALGPS1-202ENST00000319107 RUFY3Q7L099 469 aa23.66■■□□□ 1.38
RALGPS1-202ENST00000319107 GMCL1Q96IK5 515 aa23.66■■□□□ 1.38
RALGPS1-202ENST00000319107 LRRC2Q9BYS8 371 aa23.66■■□□□ 1.38
RALGPS1-202ENST00000319107 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
RALGPS1-202ENST00000319107 SENP2Q9HC62 589 aa23.66■■□□□ 1.38
RALGPS1-202ENST00000319107 TRIM17Q9Y577 477 aa23.66■■□□□ 1.38
RALGPS1-202ENST00000319107 LIFRP42702 1097 aa23.65■■□□□ 1.38
RALGPS1-202ENST00000319107 RASGRP2Q7LDG7 609 aa23.65■■□□□ 1.38
RALGPS1-202ENST00000319107 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
RALGPS1-202ENST00000319107 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
RALGPS1-202ENST00000319107 PNMA3Q9UL41 463 aa23.65■■□□□ 1.38
RALGPS1-202ENST00000319107 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa23.65■■□□□ 1.38
RALGPS1-202ENST00000319107 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
RALGPS1-202ENST00000319107 USP17L15C9J2P7 530 aa23.64■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 USP17L13C9JLJ4 530 aa23.64■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 USP17L11C9JVI0 530 aa23.64■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 USP17L18D6R9N7 530 aa23.64■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 USP17L22D6RA61 530 aa23.64■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 USP17L17D6RBQ6 530 aa23.64■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 USP17L19D6RCP7 530 aa23.64■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 USP17L20D6RJB6 530 aa23.64■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 USP17L24Q0WX57 530 aa23.64■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 FAM83BQ5T0W9 1011 aa23.64■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 OTOP1Q7RTM1 612 aa23.64■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 CD99L2Q8TCZ2 262 aa23.64■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 DCAF4Q8WV16 495 aa23.64■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.64■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 SNHG28P0DPA3 235 aa23.63■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 PDHBP11177 359 aa23.63■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 KIF22Q14807 665 aa23.63■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa23.63■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 SGMS1Q86VZ5 419 aa23.63■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 TMTC2Q8N394 836 aa23.63■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 FBXL16Q8N461 479 aa23.63■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 AGXT2Q9BYV1 514 aa23.63■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 TANGO6Q9C0B7 1094 aa23.63■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 MTMR7Q9Y216 660 aa23.63■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 POTEFA5A3E0 1075 aa23.62■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 BMP3P12645 472 aa23.62■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 OSBPP22059 807 aa23.62■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 SLC1A4P43007 532 aa23.62■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 Q6ZUG5 572 aa23.62■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 EFCC1Q9HA90 598 aa23.62■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 ADGRA2Q96PE1 1338 aa23.61■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 CCDC69A6NI79 296 aa23.61■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 CCDC96Q2M329 555 aa23.61■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF654Q8IZM8 581 aa23.61■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 KIF2CQ99661 725 aa23.61■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 MYPNQ86TC9 1320 aa23.6■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 DDAH1O94760 285 aa23.6■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 CYP2C8P10632 490 aa23.6■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 NFXL1Q6ZNB6 911 aa23.6■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 FLOT1O75955 427 aa23.59■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 FGD1P98174 961 aa23.59■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF543Q08ER8 600 aa23.59■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 KCTD1Q719H9 257 aa23.59■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 CATIPQ7Z7H3 387 aa23.59■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 BRF1Q92994 677 aa23.59■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 PDRG1Q9NUG6 133 aa23.59■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 PTPN22Q9Y2R2 807 aa23.59■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 PLA2G6O60733 806 aa23.58■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 STAT2P52630 851 aa23.58■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 HERVK_113P62684 666 aa23.58■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 TROAPQ12815 778 aa23.58■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 ASPRV1Q53RT3 343 aa23.58■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 APOA5Q6Q788 366 aa23.58■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 C17orf99Q6UX52 265 aa23.58■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 LBX2Q6XYB7 198 aa23.58■■□□□ 1.37
RALGPS1-202ENST00000319107 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms