RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313843.7

STX4-201, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene STX4, Length 1,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-201ENST00000313843 MAD2L2Q9UI95 211 aa25.54■■□□□ 1.68
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STX4-201ENST00000313843 TMEM232C9JQI7 657 aa25.44■■□□□ 1.66
STX4-201ENST00000313843 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
STX4-201ENST00000313843 FDPSP14324 419 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
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STX4-201ENST00000313843 GADL1Q6ZQY3 521 aa25.44■■□□□ 1.66
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