RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264694.12

SNX25-201, Transcript of sorting nexin 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SNX25, Length 3,264 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX25-201ENST00000264694 KRT23Q9C075 422 aa14.91□□□□□ -0.02
SNX25-201ENST00000264694 POLD4Q9HCU8 107 aa14.91□□□□□ -0.02
SNX25-201ENST00000264694 JADE2Q9NQC1 790 aa14.91□□□□□ -0.02
SNX25-201ENST00000264694 KRT2P35908 639 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX25-201ENST00000264694 PTGDRQ13258 359 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX25-201ENST00000264694 OR8K1Q8NGG5 319 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX25-201ENST00000264694 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SNX25-201ENST00000264694 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SNX25-201ENST00000264694 SAMM50Q9Y512 469 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX25-201ENST00000264694 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SNX25-201ENST00000264694 GOLGA6BA6NDN3 693 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX25-201ENST00000264694 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.022e-8■■■□□ 16.9
SNX25-201ENST00000264694 IRAK1P51617 712 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX25-201ENST00000264694 LCORLQ8N3X6 602 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX25-201ENST00000264694 HAUS4Q9H6D7 363 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX25-201ENST00000264694 CNNM2Q9H8M5 875 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX25-201ENST00000264694 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX25-201ENST00000264694 V9GY48 417 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SNX25-201ENST00000264694 WDR17Q8IZU2 1322 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX25-201ENST00000264694 MINDY4BA8MYZ0 360 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX25-201ENST00000264694 CYP27A1Q02318 531 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX25-201ENST00000264694 FBXW10Q5XX13 1052 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX25-201ENST00000264694 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
SNX25-201ENST00000264694 HDAC7Q8WUI4 952 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX25-201ENST00000264694 UBAC1Q9BSL1 405 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX25-201ENST00000264694 RWDD2AQ9UIY3 292 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX25-201ENST00000264694 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa14.89□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 ERLIN2O94905 339 aa14.89□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 PLEKHA8P1O95397 391 aa14.89□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 PRCPP42785 496 aa14.89□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 WDR59Q6PJI9 974 aa14.89□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 BCAS4Q8TDM0 211 aa14.89□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 PSMB7Q99436 277 aa14.89□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 FAM169AQ9Y6X4 670 aa14.89□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa14.89□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 ABCC12Q96J65 1359 aa14.89□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 LRRC10BA6NIK2 292 aa14.89□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 KLK7P49862 253 aa14.89□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 CSF1RP07333 972 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 IDEP14735 1019 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 PMS1P54277 932 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 EIF5P55010 431 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 SPAG1Q07617 926 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 TRIM14Q14142 442 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 PKN1Q16512 942 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 TTC38Q5R3I4 469 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 BRMS1Q9HCU9 246 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 FBXO3Q9UK99 471 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 EBAG9O00559 213 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 MCM3P25205 808 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 MCM7P33993 719 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 GNGT1P63211 74 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 SLC7A5Q01650 507 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 IRF2BP1Q8IU81 584 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 ATRNO75882 1429 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 ALX1Q15699 326 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 MB21D1Q8N884 522 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 TNKSO95271 1327 aa14.87□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa14.87□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 FERMT2Q96AC1 680 aa14.87□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 PLIN2Q99541 437 aa14.87□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 CAPS2Q9BXY5 557 aa14.87□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 YY1AP1Q9H869 796 aa14.87□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 LMTK3Q96Q04 1460 aa14.87□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 LAMB4A4D0S4 1761 aa14.87□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 PDE8BO95263 885 aa14.87□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 RPN1P04843 607 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 XBP1P17861 261 aa14.87□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 SPATA5Q8NB90 893 aa14.87□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 KIF1AQ12756 1690 aa14.87□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 B4DLN1 442 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 KRT86O43790 486 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 MAP3K12Q12852 859 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 RASGRF1Q13972 1273 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 PDXDC2PQ6P474 469 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 EP400NLQ6ZTU2 488 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 SDR42E1Q8WUS8 393 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 PHF20Q9BVI0 1012 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 MYH7P12883 1935 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 PKD1L3Q7Z443 1732 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SNX25-201ENST00000264694 ADAMTS3O15072 1205 aa14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms