RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 JAKMIP2Q96AA8 810 aa9.92□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 CEP89Q96ST8 783 aa9.92□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 THAP9Q9H5L6 903 aa9.92□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 JADE2Q9NQC1 790 aa9.92□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 SCN11AQ9UI33 1791 aa9.92□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 ERLIN2O94905 339 aa9.92□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP9.92□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 HLA-DOAP06340 250 aa9.92□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 FGFR2P21802 821 aa9.92□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 CCDC96Q2M329 555 aa9.92□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 CTR9Q6PD62 1173 aa9.92□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 ERMNQ8TAM6 284 aa9.92□□□□□ -0.82
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HERC3-201ENST00000264345 MFAP3LO75121 409 aa9.92□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 BLZF1Q9H2G9 400 aa9.92□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
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HERC3-201ENST00000264345 PHF20Q9BVI0 1012 aa9.91□□□□□ -0.82
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HERC3-201ENST00000264345 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 RGPD2P0DJD1 1756 aa9.91□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 ITIH6Q6UXX5 1313 aa9.91□□□□□ -0.82
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HERC3-201ENST00000264345 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
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HERC3-201ENST00000264345 CCDC151A5D8V7 595 aa9.91□□□□□ -0.82
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HERC3-201ENST00000264345 TSKSQ9UJT2 592 aa9.91□□□□□ -0.82
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HERC3-201ENST00000264345 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa9.91□□□□□ -0.82
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HERC3-201ENST00000264345 IDEP14735 1019 aa9.9□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
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HERC3-201ENST00000264345 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa9.9□□□□□ -0.82
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HERC3-201ENST00000264345 TNS2Q63HR2 1409 aa9.9□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 LAMB4A4D0S4 1761 aa9.9□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 A6NNZ2 444 aa9.9□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 PRR29P0C7W0 189 aa9.9□□□□□ -0.82
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HERC3-201ENST00000264345 TUBB8Q3ZCM7 444 aa9.9□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 TEX11Q8IYF3 940 aa9.9□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa9.9□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 EHMT1Q9H9B1 1298 aa9.9□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 ZNF804BA4D1E1 1349 aa9.9□□□□□ -0.83
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HERC3-201ENST00000264345 RIC1Q4ADV7 1423 aa9.9□□□□□ -0.83
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HERC3-201ENST00000264345 RHOXF2Q9BQY4 288 aa9.9□□□□□ -0.83
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HERC3-201ENST00000264345 MRFAP1Q9Y605 127 aa9.89□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa9.89□□□□□ -0.83
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HERC3-201ENST00000264345 HSF2BPO75031 334 aa9.89□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 ADCY7P51828 1080 aa9.89□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 OXER1Q8TDS5 423 aa9.89□□□□□ -0.83
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HERC3-201ENST00000264345 EPSTI1Q96J88 318 aa9.89□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 VPS18Q9P253 973 aa9.89□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 SAR1BQ9Y6B6 198 aa9.89□□□□□ -0.83
HERC3-201ENST00000264345 GNA14O95837 355 aa9.89□□□□□ -0.83
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