RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261407.8

LPCAT3-201, Transcript of lysophosphatidylcholine acyltransferase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LPCAT3, Length 2,268 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT3-201ENST00000261407 SPATA1Q5VX52 437 aa21.84■■□□□ 1.09
LPCAT3-201ENST00000261407 PDXDC2PQ6P474 469 aa21.84■■□□□ 1.09
LPCAT3-201ENST00000261407 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa21.84■■□□□ 1.09
LPCAT3-201ENST00000261407 C4orf32Q8N8J7 132 aa21.84■■□□□ 1.09
LPCAT3-201ENST00000261407 GSDMAQ96QA5 445 aa21.84■■□□□ 1.09
LPCAT3-201ENST00000261407 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
LPCAT3-201ENST00000261407 GRAPQ13588 217 aa21.83■■□□□ 1.09
LPCAT3-201ENST00000261407 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
LPCAT3-201ENST00000261407 FAM196AQ6ZSG2 479 aa21.83■■□□□ 1.09
LPCAT3-201ENST00000261407 BLIDQ8IZY5 108 aa21.83■■□□□ 1.09
LPCAT3-201ENST00000261407 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
LPCAT3-201ENST00000261407 STX8Q9UNK0 236 aa21.83■■□□□ 1.09
LPCAT3-201ENST00000261407 CTNND2Q9UQB3 1225 aa21.83■■□□□ 1.09
LPCAT3-201ENST00000261407 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa21.83■■□□□ 1.09
LPCAT3-201ENST00000261407 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa21.83■■□□□ 1.09
LPCAT3-201ENST00000261407 PP2D1A8MPX8 630 aa21.83■■□□□ 1.09
LPCAT3-201ENST00000261407 KIF5BP33176 963 aa21.83■■□□□ 1.09
LPCAT3-201ENST00000261407 TRAPPC3LQ5T215 181 aa21.83■■□□□ 1.09
LPCAT3-201ENST00000261407 TSPY3P0CV98 308 aa21.82■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 TSPY8P0CW00 308 aa21.82■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 DGKHQ86XP1 1220 aa21.82■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP21.82■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 A0A0U1RQJ8 604 aa21.82■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 RBL2Q08999 1139 aa21.82■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 KARSQ15046 597 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 WWC2Q6AWC2 1192 aa21.82■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 IQUBQ8NA54 791 aa21.82■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 WDR66Q8TBY9 1149 aa21.82■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 ATRIPQ8WXE1 791 aa21.82■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 WDR24Q96S15 920 aa21.82■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 SOWAHDA6NJG2 315 aa21.81■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 GPSM2P81274 684 aa21.81■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 CDKAL1Q5VV42 579 aa21.81■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 CNBD1Q8NA66 436 aa21.81■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 PLIN2Q99541 437 aa21.81■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 TMEM60Q9H2L4 133 aa21.81■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 STX10O60499 249 aa21.81■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 TOM1O60784 492 aa21.81■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 CCDC34Q96HJ3 373 aa21.81■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 LRRC4BQ9NT99 713 aa21.81■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 USP21Q9UK80 565 aa21.81■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 PCDHA4Q9UN74 947 aa21.81■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 M0R2N6 131 aa21.8■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 URI1O94763 535 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 TRAPPC10P48553 1259 aa21.8■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 RRAGBQ5VZM2 374 aa21.8■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa21.8■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 CREBRFQ8IUR6 639 aa21.8■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 TMEM47Q9BQJ4 181 aa21.8■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 SBF2Q86WG5 1849 aa21.8■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 GRM4Q14833 912 aa21.8■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 INF2Q27J81 1249 aa21.8■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 IGSF22Q8N9C0 903 aa21.8■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 PCDHA6Q9UN73 950 aa21.8■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 GDAQ9Y2T3 454 aa21.8■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 LEMD3Q9Y2U8 911 aa21.8■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa21.8■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa21.79■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 CCP110O43303 1012 aa21.79■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 ZSCAN12O43309 604 aa21.79■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 RASA1P20936 1047 aa21.79■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 PARP3Q9Y6F1 533 aa21.79■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 PBX1P40424 430 aa21.78■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 PRR5LQ6MZQ0 368 aa21.78■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 MAST2Q6P0Q8 1798 aa21.78■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 CALML3P27482 149 aa21.78■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 BTDP43251 543 aa21.78■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 FCHSD1Q86WN1 690 aa21.78■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 ANKS1AQ92625 1134 aa21.78■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 BAG3O95817 575 aa21.77■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 GNG11P61952 73 aa21.77■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 NAALADL2Q58DX5 795 aa21.77■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 RAD9BQ6WBX8 426 aa21.77■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 LRRC15Q8TF66 581 aa21.77■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 FEZ1Q99689 392 aa21.77■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 UFL1O94874 794 aa21.77■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 CASP14P31944 242 aa21.77■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 PPP4CP60510 307 aa21.77■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 ZNF804AQ7Z570 1209 aa21.77■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 CD209Q9NNX6 404 aa21.77■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 ZNF446Q9NWS9 450 aa21.77■■□□□ 1.08
LPCAT3-201ENST00000261407 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa21.76■■□□□ 1.07
LPCAT3-201ENST00000261407 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
LPCAT3-201ENST00000261407 STXBP3O00186 592 aa21.76■■□□□ 1.07
LPCAT3-201ENST00000261407 IGSF3O75054 1194 aa21.76■■□□□ 1.07
LPCAT3-201ENST00000261407 VPS16Q9H269 839 aa21.76■■□□□ 1.07
LPCAT3-201ENST00000261407 EPC1Q9H2F5 836 aa21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms