RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258962.4

SRSF1-201, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRSF1, Length 1,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF1-201ENST00000258962 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 CETPP11597 493 aa20.28■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 CAP2P40123 477 aa20.28■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 RESTQ13127 1097 aa20.28■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 IFNL1Q8IU54 200 aa20.28■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 FANCBQ8NB91 859 aa20.28■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 NUP133Q8WUM0 1156 aa20.28■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 EHD4Q9H223 541 aa20.28■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF287Q9HBT7 754 aa20.28■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa20.28■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 ZHX2Q9Y6X8 837 aa20.28■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa20.27■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 H3BQV1 296 aa20.27■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 DDAH1O94760 285 aa20.27■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 PTPRAP18433 802 aa20.27■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 TROAPQ12815 778 aa20.27■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 CCL15Q16663 113 aa20.27■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 IFFO2Q5TF58 517 aa20.27■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 CATIPQ7Z7H3 387 aa20.27■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 ANKS1AQ92625 1134 aa20.27■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 PHKBQ93100 1093 aa20.27■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 MS4A4AQ96JQ5 239 aa20.27■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa20.27■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 STK36Q9NRP7 1315 aa20.27■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 TSPY3P0CV98 308 aa20.27■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 TSPY8P0CW00 308 aa20.27■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 IFNAR1P17181 557 aa20.27■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 CNPY2Q9Y2B0 182 aa20.27■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 CXCL11O14625 94 aa20.26■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 NBPF11Q86T75 865 aa20.26■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 DGKHQ86XP1 1220 aa20.26■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 NEDD1Q8NHV4 660 aa20.26■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 DNAJC18Q9H819 358 aa20.26■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 PRDM10Q9NQV6 1147 aa20.26■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 PLIN4Q96Q06 1357 aa20.26■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 ASNSP08243 561 aa20.25■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 CALM1P0DP23 149 aa20.25■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 CALM2P0DP24 149 aa20.25■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 CALM3P0DP25 149 aa20.25■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 GUCY1B3Q02153 619 aa20.25■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 PPP2R5BQ15173 497 aa20.25■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 CCDC178Q5BJE1 867 aa20.25■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 FAM173BQ6P4H8 233 aa20.25■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 BRI3BPQ8WY22 251 aa20.25■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 AIFM3Q96NN9 605 aa20.25■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 GDPD2Q9HCC8 539 aa20.25■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 GINM1Q9NU53 330 aa20.25■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 KCNH4Q9UQ05 1017 aa20.25■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa20.24■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 TMEM87AQ8NBN3 555 aa20.24■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 C8orf76Q96K31 380 aa20.24■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 SLC26A6Q9BXS9 759 aa20.24■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 GJB4Q9NTQ9 266 aa20.24■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 TBC1D8O95759 1140 aa20.23■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 SHMT1P34896 483 aa20.23■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa20.23■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 PTPN18Q99952 460 aa20.23■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 ALG1Q9BT22 464 aa20.23■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 SWAP70Q9UH65 585 aa20.23■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 TAOK2Q9UL54 1235 aa20.23■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa20.23■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 USP17L5A8MUK1 530 aa20.22■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 GDF11O95390 407 aa20.22■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 NOVP48745 357 aa20.22■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 FUT2Q10981 343 aa20.22■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 TATDN1Q6P1N9 297 aa20.22■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 RGS22Q8NE09 1264 aa20.22■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 KAT14Q9H8E8 782 aa20.22■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 AS3MTQ9HBK9 375 aa20.22■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 TRIM75PA6NK02 468 aa20.22■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 PLEKHA8P1O95397 391 aa20.22■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 AKR1B1P15121 316 aa20.22■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 PNMA1Q8ND90 353 aa20.22■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 CABP5Q9NP86 173 aa20.22■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 GUCY1A2P33402 732 aa20.21■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 SPP2Q13103 211 aa20.21■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 TMTC3Q6ZXV5 915 aa20.21■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 CCDC82Q8N4S0 544 aa20.21■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF280CQ8ND82 737 aa20.21■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 TMEM47Q9BQJ4 181 aa20.21■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa20.21■□□□□ 0.83
SRSF1-201ENST00000258962 MYH4Q9Y623 1939 aa20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms