RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 GPBP1Q86WP2 473 aa11.64□□□□□ -0.55
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TRPS1-201ENST00000220888 GYG1P46976 350 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 POLA2Q14181 598 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 RHOXF2Q9BQY4 288 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 NUF2Q9BZD4 464 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
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TRPS1-201ENST00000220888 SPDYE6P0CI01 402 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 BEND3Q5T5X7 828 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 SUCLG2Q96I99 432 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 SLC27A2O14975 620 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 GNA14O95837 355 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 SIK1P57059 783 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
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TRPS1-201ENST00000220888 CYP26C1Q6V0L0 522 aa11.64□□□□□ -0.55
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TRPS1-201ENST00000220888 CCDC105Q8IYK2 499 aa11.63□□□□□ -0.55
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TRPS1-201ENST00000220888 SEPT10Q9P0V9 454 aa11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 SERPINB2P05120 415 aa11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
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TRPS1-201ENST00000220888 C8orf74Q6P047 294 aa11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 CCDC17Q96LX7 622 aa11.63□□□□□ -0.55
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TRPS1-201ENST00000220888 ANAPC5Q9UJX4 755 aa11.63□□□□□ -0.55
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TRPS1-201ENST00000220888 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa11.63□□□□□ -0.55
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TRPS1-201ENST00000220888 ATP6V0A1Q93050 837 aa11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 TRIM31Q9BZY9 425 aa11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
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TRPS1-201ENST00000220888 COX16Q9P0S2 106 aa11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa11.63□□□□□ -0.55
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TRPS1-201ENST00000220888 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa11.62□□□□□ -0.55
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TRPS1-201ENST00000220888 FAM114A2Q9NRY5 505 aa11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 VPS54Q9P1Q0 977 aa11.62□□□□□ -0.55
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TRPS1-201ENST00000220888 ARMCX5Q6P1M9 558 aa11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 TTC30AQ86WT1 665 aa11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 MLKLQ8NB16 471 aa11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 SNX25Q9H3E2 840 aa11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 VPS37BQ9H9H4 285 aa11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 KDRP35968 1356 aa11.62□□□□□ -0.55
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