RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006015.3

HOXA11-201, Transcript of homeobox A11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA11, Length 2,295 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11-201ENST00000006015 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
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HOXA11-201ENST00000006015 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXA11-201ENST00000006015 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
HOXA11-201ENST00000006015 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXA11-201ENST00000006015 B4E1Z4 1266 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXA11-201ENST00000006015 IFNAR1P17181 557 aa22.13■■□□□ 1.13
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HOXA11-201ENST00000006015 HAUS4Q9H6D7 363 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXA11-201ENST00000006015 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
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HOXA11-201ENST00000006015 GOLGA6CA6NDK9 693 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXA11-201ENST00000006015 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.13■■□□□ 1.13
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HOXA11-201ENST00000006015 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
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HOXA11-201ENST00000006015 USP49Q70CQ1 688 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXA11-201ENST00000006015 MMS19Q96T76 1030 aa22.12■■□□□ 1.13
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HOXA11-201ENST00000006015 TRIM22Q8IYM9 498 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXA11-201ENST00000006015 MYL10Q9BUA6 226 aa22.11■■□□□ 1.13
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HOXA11-201ENST00000006015 CTNND2Q9UQB3 1225 aa22.1■■□□□ 1.13
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HOXA11-201ENST00000006015 NTSR2O95665 410 aa22.1■■□□□ 1.13
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HOXA11-201ENST00000006015 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
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HOXA11-201ENST00000006015 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
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HOXA11-201ENST00000006015 GPATCH11Q8N954 259 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXA11-201ENST00000006015 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
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HOXA11-201ENST00000006015 TRIM10Q9UDY6 481 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXA11-201ENST00000006015 A0A087X0B3 334 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXA11-201ENST00000006015 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
HOXA11-201ENST00000006015 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
HOXA11-201ENST00000006015 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXA11-201ENST00000006015 IQCEQ6IPM2 695 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXA11-201ENST00000006015 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXA11-201ENST00000006015 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXA11-201ENST00000006015 MMP14P50281 582 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXA11-201ENST00000006015 CHRNDQ07001 517 aa22.08■■□□□ 1.12
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