RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000634605.1

AC245088.2-201, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene AC245088.2, Length 394 nt, Biotype TR V gene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC245088.2-201ENST00000634605 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
AC245088.2-201ENST00000634605 TRIM32Q13049 653 aa13.15□□□□□ -0.3
AC245088.2-201ENST00000634605 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
AC245088.2-201ENST00000634605 C16orf86Q6ZW13 317 aa13.15□□□□□ -0.3
AC245088.2-201ENST00000634605 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
AC245088.2-201ENST00000634605 TRIB2Q92519 343 aa13.15□□□□□ -0.3
AC245088.2-201ENST00000634605 EMILIN3Q9NT22 766 aa13.15□□□□□ -0.3
AC245088.2-201ENST00000634605 TMOD4Q9NZQ9 345 aa13.15□□□□□ -0.3
AC245088.2-201ENST00000634605 RBPJLQ9UBG7 517 aa13.15□□□□□ -0.3
AC245088.2-201ENST00000634605 MYH8P13535 1937 aa13.15□□□□□ -0.3
AC245088.2-201ENST00000634605 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
AC245088.2-201ENST00000634605 LAMA3Q16787 3333 aa13.14□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 MINDY4BA8MYZ0 360 aa13.14□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 USP17L10C9JJH3 530 aa13.14□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 TFRCP02786 760 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 RASA1P20936 1047 aa13.14□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 ABCB5Q2M3G0 1257 aa13.14□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 ANKLE1Q8NAG6 615 aa13.14□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 USP6NLQ92738 828 aa13.14□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 C12orf42Q96LP6 360 aa13.14□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 NBPF3Q9H094 633 aa13.14□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 HELLSQ9NRZ9 838 aa13.14□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 RPTORQ8N122 1335 aa13.13□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 ALPK3Q96L96 1907 aa13.13□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 ROBO3Q96MS0 1386 aa13.13□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 PRDM1O75626 825 aa13.13□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa13.13□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 GIMAP6Q6P9H5 292 aa13.13□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa13.13□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 SOCS4Q8WXH5 440 aa13.13□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 A0A1W2PPC1 479 aa13.12□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 EVI5O60447 810 aa13.12□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 APPP05067 770 aa13.12□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 ERVK-9P63128 1117 aa13.12□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 ERVK-24P63145 666 aa13.12□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 CTDSPL2Q05D32 466 aa13.12□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 RAB3GAP1Q15042 981 aa13.12□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 Q3C1V9 767 aa13.12□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 USP17L2Q6R6M4 530 aa13.12□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 NECAB2Q7Z6G3 386 aa13.12□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 TRIM34Q9BYJ4 488 aa13.12□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 PORCNQ9H237 461 aa13.12□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 OGDHLQ9ULD0 1010 aa13.12□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 CNMDO75829 334 aa13.11□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 FGAP02671 866 aa13.11□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 GNAT2P19087 354 aa13.11□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 CYP2B6P20813 491 aa13.11□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 MAPK4P31152 587 aa13.11□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 TDO2P48775 406 aa13.11□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 MORN1Q5T089 497 aa13.11□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 NUDT12Q9BQG2 462 aa13.11□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 SWAP70Q9UH65 585 aa13.11□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP13.11□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 RLFQ13129 1914 aa13.11□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 CCDC171Q6TFL3 1326 aa13.11□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa13.1□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 CHMLP26374 656 aa13.1□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 PPARAQ07869 468 aa13.1□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 ALX1Q15699 326 aa13.1□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 GPR142Q7Z601 462 aa13.1□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa13.1□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 COL6A1P12109 1028 aa13.09□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 VCAM1P19320 739 aa13.09□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 RGS2P41220 211 aa13.09□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 FAM47AQ5JRC9 791 aa13.09□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 LBX2Q6XYB7 198 aa13.09□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 PLEKHH3Q7Z736 793 aa13.09□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 APBA2Q99767 749 aa13.09□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 GDF15Q99988 308 aa13.09□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 NAPBQ9H115 298 aa13.09□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa13.09□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 PFASO15067 1338 aa13.09□□□□□ -0.31
AC245088.2-201ENST00000634605 USP17L15C9J2P7 530 aa13.08□□□□□ -0.32
AC245088.2-201ENST00000634605 USP17L13C9JLJ4 530 aa13.08□□□□□ -0.32
AC245088.2-201ENST00000634605 USP17L11C9JVI0 530 aa13.08□□□□□ -0.32
AC245088.2-201ENST00000634605 USP17L18D6R9N7 530 aa13.08□□□□□ -0.32
AC245088.2-201ENST00000634605 USP17L22D6RA61 530 aa13.08□□□□□ -0.32
AC245088.2-201ENST00000634605 USP17L17D6RBQ6 530 aa13.08□□□□□ -0.32
AC245088.2-201ENST00000634605 USP17L19D6RCP7 530 aa13.08□□□□□ -0.32
AC245088.2-201ENST00000634605 USP17L20D6RJB6 530 aa13.08□□□□□ -0.32
AC245088.2-201ENST00000634605 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
AC245088.2-201ENST00000634605 EEF2P13639 858 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
AC245088.2-201ENST00000634605 USP14P54578 494 aa13.08□□□□□ -0.32
AC245088.2-201ENST00000634605 HAND2P61296 217 aa13.08□□□□□ -0.32
AC245088.2-201ENST00000634605 PTH1RQ03431 593 aa13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms