RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591412.5

CTIF-210, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 491 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-210ENST00000591412 TMX2Q9Y320 296 aa15.98■□□□□ 0.15
CTIF-210ENST00000591412 CEP290O15078 2479 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-210ENST00000591412 GSG1L2A8MUP6 293 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-210ENST00000591412 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CTIF-210ENST00000591412 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CTIF-210ENST00000591412 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
CTIF-210ENST00000591412 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
CTIF-210ENST00000591412 ICA1Q05084 483 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-210ENST00000591412 COG2Q14746 738 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-210ENST00000591412 CCL14Q16627 93 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-210ENST00000591412 SBK1Q52WX2 424 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-210ENST00000591412 AMOTL1Q8IY63 956 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-210ENST00000591412 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CTIF-210ENST00000591412 APPBP2Q92624 585 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-210ENST00000591412 LPAR1Q92633 364 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-210ENST00000591412 DDRGK1Q96HY6 314 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-210ENST00000591412 APBA2Q99767 749 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-210ENST00000591412 HOXC10Q9NYD6 342 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-210ENST00000591412 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
CTIF-210ENST00000591412 TTC41PQ6P2S7 1318 aa15.96■□□□□ 0.15
CTIF-210ENST00000591412 SLC15A5A6NIM6 579 aa15.96■□□□□ 0.15
CTIF-210ENST00000591412 PTPREP23469 700 aa15.96■□□□□ 0.15
CTIF-210ENST00000591412 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CTIF-210ENST00000591412 MAP2K5Q13163 448 aa15.96■□□□□ 0.15
CTIF-210ENST00000591412 GIMAP6Q6P9H5 292 aa15.96■□□□□ 0.15
CTIF-210ENST00000591412 ANKLE1Q8NAG6 615 aa15.96■□□□□ 0.15
CTIF-210ENST00000591412 PI4K2BQ8TCG2 481 aa15.96■□□□□ 0.15
CTIF-210ENST00000591412 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CTIF-210ENST00000591412 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CTIF-210ENST00000591412 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.15
CTIF-210ENST00000591412 VCPKMTQ9H867 229 aa15.96■□□□□ 0.15
CTIF-210ENST00000591412 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa15.96■□□□□ 0.15
CTIF-210ENST00000591412 OGDHLQ9ULD0 1010 aa15.96■□□□□ 0.15
CTIF-210ENST00000591412 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 IGHA2P01877 340 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 DSG3P32926 999 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 GRB14Q14449 540 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 TANGO6Q9C0B7 1094 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 SH2D4AQ9H788 454 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 FLRT1Q9NZU1 646 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 RLFQ13129 1914 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 M0R2C6 588 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 GPAA1O43292 621 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 HOXC6P09630 235 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 EEF2P13639 858 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 NECAB2Q7Z6G3 386 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 SPICE1Q8N0Z3 855 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 SPATC1LQ9H0A9 340 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 KANSL2Q9H9L4 492 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 ROBO3Q96MS0 1386 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 WDR46O15213 610 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 WDR78Q5VTH9 848 aa15.93■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 LHX8Q68G74 356 aa15.93■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 CHRDL2Q6WN34 429 aa15.93■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 MB21D1Q8N884 522 aa15.93■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 SHCBP1Q8NEM2 672 aa15.93■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 NPLOC4Q8TAT6 608 aa15.93■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 CRBNQ96SW2 442 aa15.93■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 PRO3102Q9H379 93 aa15.93■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 NR2E3Q9Y5X4 410 aa15.93■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 A0A0G2JMZ2 1700 aa15.93■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 SALL3Q9BXA9 1300 aa15.93■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 MYH8P13535 1937 aa15.92■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 ERC2O15083 957 aa15.92■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 FLOT1O75955 427 aa15.92■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 GNAT2P19087 354 aa15.92■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 ERCC3P19447 782 aa15.92■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 RASA1P20936 1047 aa15.92■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 ATG4CQ96DT6 458 aa15.92■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa15.92■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa15.92■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 MINDY4BA8MYZ0 360 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 EVI5O60447 810 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 MX1P20591 662 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 MFSD14CQ5VZR4 134 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 NBPF3Q9H094 633 aa15.91■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 STRNO43815 780 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 ADORA2AP29274 412 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 ATP2B2Q01814 1243 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 TMEM132BQ14DG7 1078 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 IFNL3Q8IZI9 196 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 STK11IPQ8N1F8 1099 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 C11orf49Q9H6J7 331 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 MKNK2Q9HBH9 465 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 PCDH10Q9P2E7 1040 aa15.9■□□□□ 0.14
CTIF-210ENST00000591412 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms