RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589550.1

PIK3C3-211, Transcript of phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

TSL 3

Gene PIK3C3, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3-211ENST00000589550 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 NSMFQ6X4W1 530 aa7.18□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 CDC37L1Q7L3B6 337 aa7.18□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 NECAB2Q7Z6G3 386 aa7.18□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa7.18□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 GALNT11Q8NCW6 608 aa7.18□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 LRRN4CLQ8ND94 238 aa7.18□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF417Q8TAU3 575 aa7.18□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 PPP1R14AQ96A00 147 aa7.18□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 IGF1RP08069 1367 aa7.18□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 NOP56O00567 594 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 CBFA2T2O43439 604 aa7.17□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 PRC1O43663 620 aa7.17□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 EFCAB14O75071 495 aa7.17□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 ADAM11O75078 769 aa7.17□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 PPM1BO75688 479 aa7.17□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 ALDH1L1O75891 902 aa7.17□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 VSIG8P0DPA2 414 aa7.17□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 NTF4P34130 210 aa7.17□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.17□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 CNNM4Q6P4Q7 775 aa7.17□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 POMZP3Q6PJE2 187 aa7.17□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 CCDC146Q8IYE0 955 aa7.17□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 DTWD1Q8N5C7 304 aa7.17□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 UBR7Q8N806 425 aa7.17□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 BVESQ8NE79 360 aa7.17□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 WHRNQ9P202 907 aa7.17□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa7.17□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa7.17□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 C9IYK1 514 aa7.16□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 PRODHO43272 600 aa7.16□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 DLGAP3O95886 979 aa7.16□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 CST3P01034 146 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 CAPNS1P04632 268 aa7.16□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 SDSP20132 328 aa7.16□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 GABREP78334 506 aa7.16□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 FANCD2OSQ96PS1 177 aa7.16□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 MYH16Q9H6N6 1097 aa7.16□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 FBRSQ9HAH7 460 aa7.16□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 FAM86C1Q9NVL1 165 aa7.16□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 APEX2Q9UBZ4 518 aa7.16□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa7.16□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 ERBB4Q15303 1308 aa7.16□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 KIF3BO15066 747 aa7.15□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 EYA4O95677 639 aa7.15□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 GUCY2FP51841 1108 aa7.15□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 RNF4P78317 190 aa7.15□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 CHSY3Q70JA7 882 aa7.15□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 ILDR2Q71H61 639 aa7.15□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 OSBP2Q969R2 916 aa7.15□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 FGD4Q96M96 766 aa7.15□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa7.15□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 TRIM39Q9HCM9 518 aa7.15□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 DISC1Q9NRI5 854 aa7.15□□□□□ -1.26
PIK3C3-211ENST00000589550 MEGF11A6BM72 1044 aa7.14□□□□□ -1.27
PIK3C3-211ENST00000589550 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PIK3C3-211ENST00000589550 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PIK3C3-211ENST00000589550 RASGRP1O95267 797 aa7.14□□□□□ -1.27
PIK3C3-211ENST00000589550 ASLP04424 464 aa7.14□□□□□ -1.27
PIK3C3-211ENST00000589550 KCNMA1Q12791 1236 aa7.14□□□□□ -1.27
PIK3C3-211ENST00000589550 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
PIK3C3-211ENST00000589550 DHCR24Q15392 516 aa7.14□□□□□ -1.27
PIK3C3-211ENST00000589550 NKG7Q16617 165 aa7.14□□□□□ -1.27
PIK3C3-211ENST00000589550 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PIK3C3-211ENST00000589550 GORABQ5T7V8 394 aa7.14□□□□□ -1.27
PIK3C3-211ENST00000589550 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa7.14□□□□□ -1.27
PIK3C3-211ENST00000589550 DCAF15Q66K64 600 aa7.14□□□□□ -1.27
PIK3C3-211ENST00000589550 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PIK3C3-211ENST00000589550 TRIM59Q8IWR1 403 aa7.14□□□□□ -1.27
PIK3C3-211ENST00000589550 GSTCDQ8NEC7 633 aa7.14□□□□□ -1.27
PIK3C3-211ENST00000589550 MRGPRX3Q96LB0 322 aa7.14□□□□□ -1.27
PIK3C3-211ENST00000589550 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PIK3C3-211ENST00000589550 SUGCTQ9HAC7 445 aa7.14□□□□□ -1.27
PIK3C3-211ENST00000589550 GABBR1Q9UBS5 961 aa7.14□□□□□ -1.27
PIK3C3-211ENST00000589550 AP4E1Q9UPM8 1137 aa7.14□□□□□ -1.27
PIK3C3-211ENST00000589550 A0A087WZG4 1122 aa7.13□□□□□ -1.27
PIK3C3-211ENST00000589550 BRINP1O60477 761 aa7.13□□□□□ -1.27
PIK3C3-211ENST00000589550 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PIK3C3-211ENST00000589550 ITGA4P13612 1032 aa7.13□□□□□ -1.27
PIK3C3-211ENST00000589550 CD247P20963 164 aa7.13□□□□□ -1.27
PIK3C3-211ENST00000589550 FLT3P36888 993 aa7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms