RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 ASNSP08243 561 aa36.05■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 MTMR6Q9Y217 621 aa36.05■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP36.04■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 PHF20L1A8MW92 1017 aa36.04■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 DEXIO95424 95 aa36.04■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 SNHG28P0DPA3 235 aa36.04■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 EEF2P13639 858 aaKnown RBP36.04■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 SMARCA1P28370 1054 aa36.04■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 CLEC17AQ6ZS10 378 aa36.04■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 SULF1Q8IWU6 871 aa36.04■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 PHKBQ93100 1093 aa36.04■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC26A6Q9BXS9 759 aa36.04■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF341Q9BYN7 854 aa36.04■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 MAD2L2Q9UI95 211 aa36.04■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 TCHHQ07283 1943 aa36.04■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 MYH15Q9Y2K3 1946 aa36.04■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 FUT2Q10981 343 aa36.03■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 H3BQV1 296 aa36.02■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 ASPRV1Q53RT3 343 aa36.02■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 IFFO2Q5TF58 517 aa36.02■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa36.02■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 DTNBO60941 627 aa36.01■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 PDHBP11177 359 aa36.01■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 CLEC10AQ8IUN9 316 aa36.01■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP36.01■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa36.01■■■■□ 3.36
CAPNS1-206ENST00000588815 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP36■■■■□ 3.35
CAPNS1-206ENST00000588815 PLEKHA8P1O95397 391 aa36■■■■□ 3.35
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP2B2Q01814 1243 aa36■■■■□ 3.35
CAPNS1-206ENST00000588815 C8orf76Q96K31 380 aa36■■■■□ 3.35
CAPNS1-206ENST00000588815 GBP4Q96PP9 640 aa36■■■■□ 3.35
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF112Q9UJU3 913 aa36■■■■□ 3.35
CAPNS1-206ENST00000588815 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa36■■■■□ 3.35
CAPNS1-206ENST00000588815 JAG1P78504 1218 aa35.99■■■■□ 3.35
CAPNS1-206ENST00000588815 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa35.99■■■■□ 3.35
CAPNS1-206ENST00000588815 ALG1Q9BT22 464 aa35.99■■■■□ 3.35
CAPNS1-206ENST00000588815 F13A1P00488 732 aa35.99■■■■□ 3.35
CAPNS1-206ENST00000588815 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP35.99■■■■□ 3.35
CAPNS1-206ENST00000588815 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
CAPNS1-206ENST00000588815 SIAH1Q8IUQ4 282 aa35.99■■■■□ 3.35
CAPNS1-206ENST00000588815 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
CAPNS1-206ENST00000588815 SH2D4AQ9H788 454 aa35.99■■■■□ 3.35
CAPNS1-206ENST00000588815 SPZ1Q9BXG8 430 aa35.98■■■■□ 3.35
CAPNS1-206ENST00000588815 POTECB2RU33 542 aa35.97■■■■□ 3.35
CAPNS1-206ENST00000588815 STAG2Q8N3U4 1231 aa35.97■■■■□ 3.35
CAPNS1-206ENST00000588815 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa35.97■■■■□ 3.35
CAPNS1-206ENST00000588815 DCAF4Q8WV16 495 aa35.97■■■■□ 3.35
CAPNS1-206ENST00000588815 KLRF2D3W0D1 207 aa35.96■■■■□ 3.35
CAPNS1-206ENST00000588815 USP48Q86UV5 1035 aa35.96■■■■□ 3.35
CAPNS1-206ENST00000588815 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC82Q8N4S0 544 aa35.96■■■■□ 3.35
CAPNS1-206ENST00000588815 PPFIA3O75145 1194 aa35.95■■■■□ 3.35
CAPNS1-206ENST00000588815 CDC37L1Q7L3B6 337 aa35.95■■■■□ 3.35
CAPNS1-206ENST00000588815 KRT26Q7Z3Y9 468 aa35.95■■■■□ 3.35
CAPNS1-206ENST00000588815 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP35.95■■■■□ 3.35
CAPNS1-206ENST00000588815 TMX2Q9Y320 296 aa35.95■■■■□ 3.35
CAPNS1-206ENST00000588815 SSC5DA1L4H1 1573 aa35.95■■■■□ 3.34
CAPNS1-206ENST00000588815 USP17L5A8MUK1 530 aa35.94■■■■□ 3.34
CAPNS1-206ENST00000588815 XBP1P17861 261 aa35.94■■■■□ 3.34
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF543Q08ER8 600 aa35.94■■■■□ 3.34
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIM29Q14134 588 aa35.94■■■■□ 3.34
CAPNS1-206ENST00000588815 USP17L2Q6R6M4 530 aa35.94■■■■□ 3.34
CAPNS1-206ENST00000588815 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa35.94■■■■□ 3.34
CAPNS1-206ENST00000588815 GMCL1Q96IK5 515 aa35.93■■■■□ 3.34
CAPNS1-206ENST00000588815 MTMR7Q9Y216 660 aa35.93■■■■□ 3.34
CAPNS1-206ENST00000588815 PHIPQ8WWQ0 1821 aa35.93■■■■□ 3.34
CAPNS1-206ENST00000588815 GOPCQ9HD26 462 aa35.92■■■■□ 3.34
CAPNS1-206ENST00000588815 V9GY48 417 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
CAPNS1-206ENST00000588815 SLFN13Q68D06 897 aa35.92■■■■□ 3.34
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
CAPNS1-206ENST00000588815 F5H6K3 240 aa35.91■■■■□ 3.34
CAPNS1-206ENST00000588815 KLRC3Q07444 240 aa35.91■■■■□ 3.34
CAPNS1-206ENST00000588815 KLRG1Q96E93 195 aa35.91■■■■□ 3.34
CAPNS1-206ENST00000588815 OTOFQ9HC10 1997 aa35.9■■■■□ 3.34
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC1A4P43007 532 aa35.9■■■■□ 3.34
CAPNS1-206ENST00000588815 PKN1Q16512 942 aa35.9■■■■□ 3.34
CAPNS1-206ENST00000588815 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
CAPNS1-206ENST00000588815 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
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CAPNS1-206ENST00000588815 SCYL3Q8IZE3 742 aa35.9■■■■□ 3.34
CAPNS1-206ENST00000588815 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
CAPNS1-206ENST00000588815 RIOX1Q9H6W3 641 aa35.9■■■■□ 3.34
CAPNS1-206ENST00000588815 BAG4O95429 457 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
CAPNS1-206ENST00000588815 GOLGA8HP0CJ92 632 aa35.89■■■■□ 3.34
CAPNS1-206ENST00000588815 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
CAPNS1-206ENST00000588815 NF2P35240 595 aa35.89■■■■□ 3.34
CAPNS1-206ENST00000588815 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
CAPNS1-206ENST00000588815 WRNIP1Q96S55 665 aa35.89■■■■□ 3.34
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1W2PRG0 241 aa35.88■■■■□ 3.33
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