RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 SGMS1Q86VZ5 419 aa29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-204ENST00000587718 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-204ENST00000587718 NBPF3Q9H094 633 aa29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-204ENST00000587718 NID2Q14112 1375 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-204ENST00000587718 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-204ENST00000587718 CAVIN2O95810 425 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-204ENST00000587718 SOX10P56693 466 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-204ENST00000587718 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-204ENST00000587718 SLF2Q8IX21 1173 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-204ENST00000587718 KRT23Q9C075 422 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-204ENST00000587718 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-204ENST00000587718 ATRNL1Q5VV63 1379 aa29.49■■■□□ 2.31
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CAPNS1-204ENST00000587718 ENTPD3O75355 529 aa29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-204ENST00000587718 LIFRP42702 1097 aa29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-204ENST00000587718 MECOMQ03112 1051 aa29.48■■■□□ 2.31
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CAPNS1-204ENST00000587718 OTOP1Q7RTM1 612 aa29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-204ENST00000587718 BRAPQ7Z569 592 aa29.48■■■□□ 2.31
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CAPNS1-204ENST00000587718 MAGEB6Q8N7X4 407 aa29.48■■■□□ 2.31
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CAPNS1-204ENST00000587718 FAM173BQ6P4H8 233 aa29.47■■■□□ 2.31
CAPNS1-204ENST00000587718 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa29.47■■■□□ 2.31
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CAPNS1-204ENST00000587718 ERO1AQ96HE7 468 aa29.47■■■□□ 2.31
CAPNS1-204ENST00000587718 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
CAPNS1-204ENST00000587718 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
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CAPNS1-204ENST00000587718 MYH2Q9UKX2 1941 aa29.46■■■□□ 2.31
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CAPNS1-204ENST00000587718 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa29.46■■■□□ 2.31
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CAPNS1-204ENST00000587718 MBD4O95243 580 aa29.45■■■□□ 2.31
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CAPNS1-204ENST00000587718 RHBDL3P58872 404 aa29.45■■■□□ 2.31
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CAPNS1-204ENST00000587718 C8orf76Q96K31 380 aa29.44■■■□□ 2.3
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
CAPNS1-204ENST00000587718 GSG1L2A8MUP6 293 aa29.43■■■□□ 2.3
CAPNS1-204ENST00000587718 PHF20L1A8MW92 1017 aa29.43■■■□□ 2.3
CAPNS1-204ENST00000587718 BTBD19C9JJ37 291 aa29.43■■■□□ 2.3
CAPNS1-204ENST00000587718 TNMDQ9H2S6 317 aa29.43■■■□□ 2.3
CAPNS1-204ENST00000587718 RTEL1Q9NZ71 1219 aa29.43■■■□□ 2.3
CAPNS1-204ENST00000587718 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
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CAPNS1-204ENST00000587718 GIMAP6Q6P9H5 292 aa29.43■■■□□ 2.3
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CAPNS1-204ENST00000587718 STK36Q9NRP7 1315 aa29.42■■■□□ 2.3
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CAPNS1-204ENST00000587718 TMTC2Q8N394 836 aa29.42■■■□□ 2.3
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CAPNS1-204ENST00000587718 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa29.42■■■□□ 2.3
CAPNS1-204ENST00000587718 DACT1Q9NYF0 836 aa29.42■■■□□ 2.3
CAPNS1-204ENST00000587718 ANAPC4Q9UJX5 808 aa29.42■■■□□ 2.3
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CAPNS1-204ENST00000587718 YEATS4O95619 227 aa29.41■■■□□ 2.3
CAPNS1-204ENST00000587718 PCP11498 1178 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
CAPNS1-204ENST00000587718 CYB5R4Q7L1T6 521 aa29.41■■■□□ 2.3
CAPNS1-204ENST00000587718 LRP2BPQ9P2M1 347 aa29.41■■■□□ 2.3
CAPNS1-204ENST00000587718 PTPN22Q9Y2R2 807 aa29.41■■■□□ 2.3
CAPNS1-204ENST00000587718 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP29.4■■■□□ 2.34e-11■□□□□ 10.1
CAPNS1-204ENST00000587718 APOA5Q6Q788 366 aa29.4■■■□□ 2.3
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM200AQ8TCP9 573 aa29.4■■■□□ 2.3
CAPNS1-204ENST00000587718 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
CAPNS1-204ENST00000587718 HTTP42858 3142 aa29.4■■■□□ 2.3
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1W2PQ27 194 aa29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1W2PQ64 194 aa29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1W2PQD8 194 aa29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-204ENST00000587718 TLR2O60603 784 aa29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-204ENST00000587718 KDM4AO75164 1064 aa29.39■■■□□ 2.3
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