RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580262.2

MYO15B-216, Transcript of myosin XVB, human

TSL 3

Gene MYO15B, Length 707 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MYO15B-216	ENST00000580262	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
MYO15B-216	ENST00000580262	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MYO15B-216	ENST00000580262	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	13.34	□□□□□ -0.27
MYO15B-216	ENST00000580262	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MYO15B-216	ENST00000580262	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
MYO15B-216	ENST00000580262	FEZ1	Q99689	392 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MYO15B-216	ENST00000580262	GOPC	Q9HD26	462 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MYO15B-216	ENST00000580262	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
MYO15B-216	ENST00000580262	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MYO15B-216	ENST00000580262	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MYO15B-216	ENST00000580262	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
MYO15B-216	ENST00000580262	UNCX	A6NJT0	531 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	USP17L5	A8MUK1	530 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	RAD21	O60216	631 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	PFKFB2	O60825	505 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	CDKL5	O76039	1030 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	INPP5B	P32019	993 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	HUNK	P57058	714 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	NOV	P48745	357 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	GNAQ	P50148	359 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	MAP3K11	Q16584	847 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	ME3	Q16798	604 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	RTN1	Q16799	776 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	GTF3C6	Q969F1	213 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	CAPNS2	Q96L46	248 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	ZIC5	Q96T25	663 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	MAP3K14	Q99558	947 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	13.32	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	KIF3A	Q9Y496	699 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	NID2	Q14112	1375 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	AOC2	O75106	756 aa		13.31	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	GUCY1A2	P33402	732 aa		13.31	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	USP14	P54578	494 aa		13.31	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	MKL1	Q969V6	931 aa		13.31	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	MYL10	Q9BUA6	226 aa		13.31	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	MTMR7	Q9Y216	660 aa		13.31	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	LARGE1	O95461	756 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	PTPRA	P18433	802 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	CUL4A	Q13619	759 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	VGLL4	Q14135	290 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	CCDC96	Q2M329	555 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	RGMB	Q6NW40	437 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	FANCB	Q8NB91	859 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	DCAF4	Q8WV16	495 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	SENP2	Q9HC62	589 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	TMX2	Q9Y320	296 aa		13.3	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	USP17L10	C9JJH3	530 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	RXRA	P19793	462 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	SLC1A4	P43007	532 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	SCRN1	Q12765	414 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	TROAP	Q12815	778 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	GRM1	Q13255	1194 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	GRM4	Q14833	912 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	SLFN13	Q68D06	897 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	ERO1B	Q86YB8	467 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	NECAB1	Q8N987	351 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	LPAR1	Q92633	364 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	WDR18	Q9BV38	432 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		13.29	□□□□□ -0.28
MYO15B-216	ENST00000580262	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms