RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		11.24	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		11.24	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		11.24	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		11.24	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	VCPKMT	Q9H867	229 aa		11.24	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		11.24	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	BTBD7	Q9P203	1132 aa		11.24	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	RPTOR	Q8N122	1335 aa		11.24	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	PTPRE	P23469	700 aa		11.23	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	RGS2	P41220	211 aa		11.23	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		11.23	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		11.23	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	MORN1	Q5T089	497 aa		11.23	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		11.23	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	TRIB2	Q92519	343 aa		11.23	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	USP6NL	Q92738	828 aa		11.23	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	DPF3	Q92784	378 aa		11.23	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	EVI5L	Q96CN4	794 aa		11.23	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	11.23	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	STAP2	Q9UGK3	403 aa		11.23	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		11.23	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	RAD21	O60216	631 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	FLOT1	O75955	427 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	RASA1	P20936	1047 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	DSG3	P32926	999 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	PDE1A	P54750	535 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	TRIM32	Q13049	653 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	MAP2K5	Q13163	448 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	GOPC	Q9HD26	462 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	STRN	O43815	780 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	PLS1	Q14651	629 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	MB21D1	Q8N884	522 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	11.21	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	NAPB	Q9H115	298 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	NYAP2	Q9P242	653 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	MGAM	O43451	1857 aa		11.21	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		11.21	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	IGHD	P01880	384 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	PDE4B	Q07343	736 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	CCL14	Q16627	93 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	DPP9	Q86TI2	863 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	SMC5	Q8IY18	1101 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	APBA2	Q99767	749 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	LNPK	Q9C0E8	428 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		11.19	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479		F5H6K3	240 aa		11.19	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	PRDM1	O75626	825 aa		11.19	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	HOXC6	P09630	235 aa		11.19	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	ERCC3	P19447	782 aa		11.19	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	KLRC3	Q07444	240 aa		11.19	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	PPARA	Q07869	468 aa		11.19	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	GRB14	Q14449	540 aa		11.19	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		11.19	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		11.19	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		11.19	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		11.19	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	TICAM2	Q86XR7	235 aa		11.19	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		11.19	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		11.19	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	ATG4C	Q96DT6	458 aa		11.19	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	MROH8	Q9H579	483 aa		11.19	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		11.19	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479		H0YGN5	161 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC25A27	O95847	323 aa		11.18	□□□□□ -0.62

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