RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563065.5

CCNDBP1-204, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,450 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-204ENST00000563065 TLR2O60603 784 aa20.62■□□□□ 0.89
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CCNDBP1-204ENST00000563065 CREB3L3Q68CJ9 461 aa20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-204ENST00000563065 ESR2Q92731 530 aa20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-204ENST00000563065 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
CCNDBP1-204ENST00000563065 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
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CCNDBP1-204ENST00000563065 MKL1Q969V6 931 aa20.61■□□□□ 0.89
CCNDBP1-204ENST00000563065 SH2D4AQ9H788 454 aa20.61■□□□□ 0.89
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CCNDBP1-204ENST00000563065 CAP1Q01518 475 aa20.6■□□□□ 0.89
CCNDBP1-204ENST00000563065 KLRC3Q07444 240 aa20.6■□□□□ 0.89
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CCNDBP1-204ENST00000563065 CYB5R4Q7L1T6 521 aa20.6■□□□□ 0.89
CCNDBP1-204ENST00000563065 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
CCNDBP1-204ENST00000563065 KRT23Q9C075 422 aa20.6■□□□□ 0.89
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CCNDBP1-204ENST00000563065 USP17L13C9JLJ4 530 aa20.59■□□□□ 0.89
CCNDBP1-204ENST00000563065 USP17L11C9JVI0 530 aa20.59■□□□□ 0.89
CCNDBP1-204ENST00000563065 USP17L18D6R9N7 530 aa20.59■□□□□ 0.89
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CCNDBP1-204ENST00000563065 USP17L24Q0WX57 530 aa20.59■□□□□ 0.89
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CCNDBP1-204ENST00000563065 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
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CCNDBP1-204ENST00000563065 MYH4Q9Y623 1939 aa20.59■□□□□ 0.89
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CCNDBP1-204ENST00000563065 CNNM2Q9H8M5 875 aa20.58■□□□□ 0.89
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CCNDBP1-204ENST00000563065 FKTNO75072 461 aa20.57■□□□□ 0.88
CCNDBP1-204ENST00000563065 FAM83BQ5T0W9 1011 aa20.57■□□□□ 0.88
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CCNDBP1-204ENST00000563065 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
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CCNDBP1-204ENST00000563065 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa20.56■□□□□ 0.88
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CCNDBP1-204ENST00000563065 CD99L2Q8TCZ2 262 aa20.56■□□□□ 0.88
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CCNDBP1-204ENST00000563065 TXNRD2Q9NNW7 524 aa20.56■□□□□ 0.88
CCNDBP1-204ENST00000563065 FBXO28Q9NVF7 368 aa20.56■□□□□ 0.88
CCNDBP1-204ENST00000563065 REC8O95072 547 aa20.55■□□□□ 0.88
CCNDBP1-204ENST00000563065 MCCP23508 829 aa20.55■□□□□ 0.88
CCNDBP1-204ENST00000563065 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
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CCNDBP1-204ENST00000563065 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CCNDBP1-204ENST00000563065 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa20.55■□□□□ 0.88
CCNDBP1-204ENST00000563065 RBPJLQ9UBG7 517 aa20.55■□□□□ 0.88
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CCNDBP1-204ENST00000563065 CTGFP29279 349 aa20.54■□□□□ 0.88
CCNDBP1-204ENST00000563065 ANTXR2P58335 489 aa20.54■□□□□ 0.88
CCNDBP1-204ENST00000563065 COG2Q14746 738 aa20.54■□□□□ 0.88
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CCNDBP1-204ENST00000563065 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa20.54■□□□□ 0.88
CCNDBP1-204ENST00000563065 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CCNDBP1-204ENST00000563065 TTC14Q96N46 770 aa20.54■□□□□ 0.88
CCNDBP1-204ENST00000563065 USP26Q9BXU7 913 aa20.54■□□□□ 0.88
CCNDBP1-204ENST00000563065 SENP2Q9HC62 589 aa20.54■□□□□ 0.88
CCNDBP1-204ENST00000563065 TNKSO95271 1327 aa20.54■□□□□ 0.88
CCNDBP1-204ENST00000563065 SEC24BO95487 1268 aa20.53■□□□□ 0.88
CCNDBP1-204ENST00000563065 ADCK5Q3MIX3 580 aa20.53■□□□□ 0.88
CCNDBP1-204ENST00000563065 RNF20Q5VTR2 975 aa20.53■□□□□ 0.88
CCNDBP1-204ENST00000563065 DGKHQ86XP1 1220 aa20.53■□□□□ 0.88
CCNDBP1-204ENST00000563065 UBAC1Q9BSL1 405 aa20.53■□□□□ 0.88
CCNDBP1-204ENST00000563065 PAGR1Q9BTK6 254 aa20.53■□□□□ 0.88
CCNDBP1-204ENST00000563065 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa20.53■□□□□ 0.88
CCNDBP1-204ENST00000563065 CNMDO75829 334 aa20.52■□□□□ 0.88
CCNDBP1-204ENST00000563065 DSG3P32926 999 aa20.52■□□□□ 0.88
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