RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR20	Q99678	358 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AKAP13-223	ENST00000560957	TNFRSF1A	P19438	455 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	LTK	P29376	864 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	VMAC	Q2NL98	169 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	OVOL3	O00110	214 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	ZXDA	P98168	799 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	RTP5	Q14D33	572 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	ADGRF1	Q5T601	910 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	NLRX1	Q86UT6	975 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM129C	Q86XR2	697 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	ARID3A	Q99856	593 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	EBF1	Q9UH73	591 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	PALD1	Q9ULE6	856 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	NOTO	A8MTQ0	251 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	GSTT1	P30711	240 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957		K7ESM1	405 aa		4.8	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	VIPR1	P32241	457 aa		4.8	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	GRK4	P32298	578 aa		4.8	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	GALK1	P51570	392 aa		4.8	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	TEK	Q02763	1124 aa		4.8	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		4.8	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		4.8	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	TMC1	Q8TDI8	760 aa		4.8	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	MZB1	Q8WU39	189 aa		4.8	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		4.8	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	SRRD	Q9UH36	339 aa		4.8	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		4.79	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	EFEMP2	O95967	443 aa		4.79	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	CDR1	P51861	262 aa		4.79	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	CAP1	Q01518	475 aa		4.79	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF827	Q17R98	1081 aa		4.79	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	4.79	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		4.79	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		4.79	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		4.79	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		4.79	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	ABLIM1	O14639	778 aa		4.78	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXO24	O75426	580 aa		4.78	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	PLCB3	Q01970	1234 aa		4.78	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC6A19	Q695T7	634 aa		4.78	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		4.78	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		4.78	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
AKAP13-223	ENST00000560957	MATN3	O15232	486 aa		4.77	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	CDK8	P49336	464 aa		4.77	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		4.77	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		4.77	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		4.77	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	VWCE	Q96DN2	955 aa		4.77	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM87B	Q96K49	555 aa		4.77	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	PWWP2A	Q96N64	755 aa		4.77	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		4.77	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	GFRA2	O00451	464 aa		4.76	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	NRDC	O43847	1150 aa		4.76	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	CELA3A	P09093	270 aa		4.76	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	DSC3	Q14574	896 aa		4.76	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	TMC7	Q7Z402	723 aa		4.76	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		4.75	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	GRIN3B	O60391	1043 aa		4.75	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	PNLIP	P16233	465 aa		4.75	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNC1	P48547	511 aa		4.75	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	ERVFRD-1	P60508	538 aa		4.75	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	ADAM17	P78536	824 aa		4.75	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	PDE4C	Q08493	712 aa		4.75	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	FFAR3	O14843	346 aa		4.74	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	PGR	P06401	933 aa		4.74	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	SLURP1	P55000	103 aa		4.74	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	UBXN11	Q5T124	520 aa		4.74	□□□□□ -1.65
AKAP13-223	ENST00000560957	LDHD	Q86WU2	507 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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