RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559586.5

RABGGTA-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-210ENST00000559586 RILPL2Q969X0 211 aa23.96■■□□□ 1.43
RABGGTA-210ENST00000559586 RBPJLQ9UBG7 517 aa23.96■■□□□ 1.43
RABGGTA-210ENST00000559586 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 GH2P01242 217 aa23.95■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 TTC22Q5TAA0 569 aa23.95■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa23.95■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 TXNRD2Q9NNW7 524 aa23.95■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 HELLSQ9NRZ9 838 aa23.95■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 EMILIN3Q9NT22 766 aa23.95■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 OGDHLQ9ULD0 1010 aa23.95■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 MYH8P13535 1937 aa23.94■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 USP17L15C9J2P7 530 aa23.94■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 USP17L13C9JLJ4 530 aa23.94■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 USP17L11C9JVI0 530 aa23.94■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 USP17L18D6R9N7 530 aa23.94■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 USP17L22D6RA61 530 aa23.94■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 USP17L17D6RBQ6 530 aa23.94■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 USP17L19D6RCP7 530 aa23.94■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 USP17L20D6RJB6 530 aa23.94■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 SDSP20132 328 aa23.94■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 GUCY1A2P33402 732 aa23.94■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 RGS2P41220 211 aa23.94■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 CCNA1P78396 465 aa23.94■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 USP17L24Q0WX57 530 aa23.94■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 IFNL3Q8IZI9 196 aa23.94■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 C12orf42Q96LP6 360 aa23.94■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 FEZ1Q99689 392 aa23.94■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa23.94■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 SZT2Q5T011 3432 aa23.94■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 TRIM32Q13049 653 aa23.93■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 VPS53Q5VIR6 699 aa23.93■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 C16orf86Q6ZW13 317 aa23.93■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 PLEKHH3Q7Z736 793 aa23.93■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 DDRGK1Q96HY6 314 aa23.93■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 C11orf49Q9H6J7 331 aa23.93■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 CABP5Q9NP86 173 aa23.93■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 BMP8BP34820 402 aa23.92■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 CDK8P49336 464 aa23.92■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 GPR142Q7Z601 462 aa23.92■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 SKAP1Q86WV1 359 aa23.92■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 USP6NLQ92738 828 aa23.92■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 PAGR1Q9BTK6 254 aa23.92■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 SWAP70Q9UH65 585 aa23.92■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 ROBO3Q96MS0 1386 aa23.91■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 ABCB5Q2M3G0 1257 aa23.91■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 Q3C1V9 767 aa23.91■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa23.91■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa23.91■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 RAB3GAP1Q15042 981 aa23.9■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 MORN1Q5T089 497 aa23.9■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 C7orf61Q8IZ16 206 aa23.9■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 APBA2Q99767 749 aa23.9■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 PORCNQ9H237 461 aa23.9■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 PLXNB2O15031 1838 aa23.89■■□□□ 1.42
RABGGTA-210ENST00000559586 APPP05067 770 aa23.89■■□□□ 1.41
RABGGTA-210ENST00000559586 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
RABGGTA-210ENST00000559586 GDF15Q99988 308 aa23.89■■□□□ 1.41
RABGGTA-210ENST00000559586 MINDY4BA8MYZ0 360 aa23.88■■□□□ 1.41
RABGGTA-210ENST00000559586 AKR1B1P15121 316 aa23.88■■□□□ 1.41
RABGGTA-210ENST00000559586 TDO2P48775 406 aa23.88■■□□□ 1.41
RABGGTA-210ENST00000559586 MAP2K5Q13163 448 aa23.88■■□□□ 1.41
RABGGTA-210ENST00000559586 SEPT2Q15019 361 aa23.88■■□□□ 1.41
RABGGTA-210ENST00000559586 LBX2Q6XYB7 198 aa23.88■■□□□ 1.41
RABGGTA-210ENST00000559586 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa23.88■■□□□ 1.41
RABGGTA-210ENST00000559586 AMOTL1Q8IY63 956 aa23.88■■□□□ 1.41
RABGGTA-210ENST00000559586 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
RABGGTA-210ENST00000559586 PEX10O60683 326 aa23.87■■□□□ 1.41
RABGGTA-210ENST00000559586 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
RABGGTA-210ENST00000559586 ALX1Q15699 326 aa23.87■■□□□ 1.41
RABGGTA-210ENST00000559586 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
RABGGTA-210ENST00000559586 ACER1Q8TDN7 264 aa23.87■■□□□ 1.41
RABGGTA-210ENST00000559586 NACAP1Q9BZK3 213 aa23.87■■□□□ 1.41
RABGGTA-210ENST00000559586 CCDC171Q6TFL3 1326 aa23.86■■□□□ 1.41
RABGGTA-210ENST00000559586 SLC15A5A6NIM6 579 aa23.86■■□□□ 1.41
RABGGTA-210ENST00000559586 NEFLP07196 543 aa23.86■■□□□ 1.41
RABGGTA-210ENST00000559586 MFSD14CQ5VZR4 134 aa23.86■■□□□ 1.41
RABGGTA-210ENST00000559586 GPR153Q6NV75 609 aa23.86■■□□□ 1.41
RABGGTA-210ENST00000559586 SIAH1Q8IUQ4 282 aa23.86■■□□□ 1.41
RABGGTA-210ENST00000559586 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP23.86■■□□□ 1.41
RABGGTA-210ENST00000559586 NAPBQ9H115 298 aa23.86■■□□□ 1.41
RABGGTA-210ENST00000559586 IL25Q9H293 177 aa23.86■■□□□ 1.41
RABGGTA-210ENST00000559586 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa23.86■■□□□ 1.41
RABGGTA-210ENST00000559586 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
RABGGTA-210ENST00000559586 VCAM1P19320 739 aa23.85■■□□□ 1.41
RABGGTA-210ENST00000559586 RASA1P20936 1047 aa23.85■■□□□ 1.41
RABGGTA-210ENST00000559586 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
RABGGTA-210ENST00000559586 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.85■■□□□ 1.41
RABGGTA-210ENST00000559586 CCDC17Q96LX7 622 aa23.85■■□□□ 1.41
RABGGTA-210ENST00000559586 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
RABGGTA-210ENST00000559586 TACC3Q9Y6A5 838 aa23.85■■□□□ 1.41
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