RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557115.5

CIPC-208, Transcript of CLOCK interacting pacemaker, humanhuman

TSL 4

Gene CIPC, Length 882 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPC-208ENST00000557115 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 NR2E3Q9Y5X4 410 aa26.06■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 SMIM22K7EJ46 135 aa26.05■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 ERC2O15083 957 aa26.05■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 LPAR1Q92633 364 aa26.05■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 MAP2K5Q13163 448 aa26.04■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 SPICE1Q8N0Z3 855 aa26.04■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 USP6NLQ92738 828 aa26.04■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 OSBP2Q969R2 916 aa26.04■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 TMX2Q9Y320 296 aa26.04■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 APPP05067 770 aa26.03■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 CCL14Q16627 93 aa26.03■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 NECAB2Q7Z6G3 386 aa26.03■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 VCPKMTQ9H867 229 aa26.03■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 KANSL2Q9H9L4 492 aa26.03■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 TTC41PQ6P2S7 1318 aa26.03■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 SLC15A5A6NIM6 579 aa26.02■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 MINDY4BA8MYZ0 360 aa26.02■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 RAD21O60216 631 aa26.02■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 EVI5O60447 810 aa26.02■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 FLOT1O75955 427 aa26.02■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 PTPREP23469 700 aa26.02■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa26.02■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 SIAH1Q8IUQ4 282 aa26.02■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 STK11IPQ8N1F8 1099 aa26.02■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 GSG1L2A8MUP6 293 aa26.01■■□□□ 1.75
CIPC-208ENST00000557115 EEF2P13639 858 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
CIPC-208ENST00000557115 GNAT2P19087 354 aa26.01■■□□□ 1.75
CIPC-208ENST00000557115 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
CIPC-208ENST00000557115 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa26.01■■□□□ 1.75
CIPC-208ENST00000557115 GIMAP6Q6P9H5 292 aa26.01■■□□□ 1.75
CIPC-208ENST00000557115 ANKLE1Q8NAG6 615 aa26.01■■□□□ 1.75
CIPC-208ENST00000557115 MKNK2Q9HBH9 465 aa26.01■■□□□ 1.75
CIPC-208ENST00000557115 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
CIPC-208ENST00000557115 GPAA1O43292 621 aa26■■□□□ 1.75
CIPC-208ENST00000557115 TDO2P48775 406 aa26■■□□□ 1.75
CIPC-208ENST00000557115 PLS1Q14651 629 aa26■■□□□ 1.75
CIPC-208ENST00000557115 SBK1Q52WX2 424 aa26■■□□□ 1.75
CIPC-208ENST00000557115 MFSD14CQ5VZR4 134 aa26■■□□□ 1.75
CIPC-208ENST00000557115 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
CIPC-208ENST00000557115 CRBNQ96SW2 442 aa26■■□□□ 1.75
CIPC-208ENST00000557115 MYH7P12883 1935 aa26■■□□□ 1.75
CIPC-208ENST00000557115 PLXNB2O15031 1838 aa26■■□□□ 1.75
CIPC-208ENST00000557115 WDR46O15213 610 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
CIPC-208ENST00000557115 DSG3P32926 999 aa25.99■■□□□ 1.75
CIPC-208ENST00000557115 CHRDL2Q6WN34 429 aa25.99■■□□□ 1.75
CIPC-208ENST00000557115 MB21D1Q8N884 522 aa25.99■■□□□ 1.75
CIPC-208ENST00000557115 FSD1Q9BTV5 496 aa25.99■■□□□ 1.75
CIPC-208ENST00000557115 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
CIPC-208ENST00000557115 NBPF3Q9H094 633 aa25.99■■□□□ 1.75
CIPC-208ENST00000557115 SPATC1LQ9H0A9 340 aa25.99■■□□□ 1.75
CIPC-208ENST00000557115 GOPCQ9HD26 462 aa25.99■■□□□ 1.75
CIPC-208ENST00000557115 MX1P20591 662 aa25.98■■□□□ 1.75
CIPC-208ENST00000557115 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
CIPC-208ENST00000557115 M0R2C6 588 aa25.97■■□□□ 1.75
CIPC-208ENST00000557115 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
CIPC-208ENST00000557115 GRB14Q14449 540 aa25.97■■□□□ 1.75
CIPC-208ENST00000557115 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25.97■■□□□ 1.75
CIPC-208ENST00000557115 DPP9Q86TI2 863 aa25.97■■□□□ 1.75
CIPC-208ENST00000557115 PI4K2BQ8TCG2 481 aa25.97■■□□□ 1.75
CIPC-208ENST00000557115 ATG4CQ96DT6 458 aa25.97■■□□□ 1.75
CIPC-208ENST00000557115 OGDHLQ9ULD0 1010 aa25.97■■□□□ 1.75
CIPC-208ENST00000557115 STRNO43815 780 aa25.96■■□□□ 1.75
CIPC-208ENST00000557115 ERCC3P19447 782 aa25.96■■□□□ 1.75
CIPC-208ENST00000557115 NACAP1Q9BZK3 213 aa25.96■■□□□ 1.75
CIPC-208ENST00000557115 ZNF287Q9HBT7 754 aa25.96■■□□□ 1.75
CIPC-208ENST00000557115 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
CIPC-208ENST00000557115 NCAPG2Q86XI2 1143 aa25.95■■□□□ 1.74
CIPC-208ENST00000557115 SHCBP1Q8NEM2 672 aa25.95■■□□□ 1.74
CIPC-208ENST00000557115 C11orf49Q9H6J7 331 aa25.95■■□□□ 1.74
CIPC-208ENST00000557115 FLRT1Q9NZU1 646 aa25.95■■□□□ 1.74
CIPC-208ENST00000557115 MYH8P13535 1937 aa25.94■■□□□ 1.74
CIPC-208ENST00000557115 HOXC6P09630 235 aa25.94■■□□□ 1.74
CIPC-208ENST00000557115 RASA1P20936 1047 aa25.94■■□□□ 1.74
CIPC-208ENST00000557115 ADORA2AP29274 412 aa25.94■■□□□ 1.74
CIPC-208ENST00000557115 CNGA1P29973 690 aa25.94■■□□□ 1.74
CIPC-208ENST00000557115 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
CIPC-208ENST00000557115 NPLOC4Q8TAT6 608 aa25.94■■□□□ 1.74
CIPC-208ENST00000557115 MROH8Q9H579 483 aa25.94■■□□□ 1.74
CIPC-208ENST00000557115 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
CIPC-208ENST00000557115 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
CIPC-208ENST00000557115 SLC5A4Q9NY91 659 aa25.93■■□□□ 1.74
CIPC-208ENST00000557115 FAM83BQ5T0W9 1011 aa25.92■■□□□ 1.74
CIPC-208ENST00000557115 IFNL3Q8IZI9 196 aa25.92■■□□□ 1.74
CIPC-208ENST00000557115 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP25.92■■□□□ 1.74
CIPC-208ENST00000557115 PRDM1O75626 825 aa25.91■■□□□ 1.74
CIPC-208ENST00000557115 CYP2C19P33261 490 aa25.91■■□□□ 1.74
CIPC-208ENST00000557115 C7orf61Q8IZ16 206 aa25.91■■□□□ 1.74
CIPC-208ENST00000557115 NAPBQ9H115 298 aa25.91■■□□□ 1.74
CIPC-208ENST00000557115 FBXO28Q9NVF7 368 aa25.91■■□□□ 1.74
CIPC-208ENST00000557115 NYAP2Q9P242 653 aa25.91■■□□□ 1.74
CIPC-208ENST00000557115 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CIPC-208ENST00000557115 ROBO3Q96MS0 1386 aa25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms