RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555015.5

SRP54-AS1-202, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 561 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-202ENST00000555015 VCAM1P19320 739 aa15.23■□□□□ 0.03
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 KRT23Q9C075 422 aa15.23■□□□□ 0.03
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 USP17L13C9JLJ4 530 aa15.2■□□□□ 0.02
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 RNF20Q5VTR2 975 aa15.2■□□□□ 0.02
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 CPA4Q9UI42 421 aa15.17■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TNKSO95271 1327 aa15.17■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MYPNQ86TC9 1320 aa15.17■□□□□ 0.02
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-202ENST00000555015 COG2Q14746 738 aa15.16■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM83BQ5T0W9 1011 aa15.16■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SLFN13Q68D06 897 aa15.16■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LBX2Q6XYB7 198 aa15.16■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ANKS1AQ92625 1134 aa15.16■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ERO1AQ96HE7 468 aa15.16■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GMCL1Q96IK5 515 aa15.16■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TMEM47Q9BQJ4 181 aa15.16■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa15.16■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FLOT1O75955 427 aa15.15■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HSPA4P34932 840 aa15.15■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TSGA10IPQ3SY00 556 aa15.15■□□□□ 0.02
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