RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551594.1

CTDSP2-207, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSP2, Length 900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-207ENST00000551594 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 C12orf42Q96LP6 360 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 SH2D4AQ9H788 454 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 TSKSQ9UJT2 592 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 TBC1D8O95759 1140 aa22.12■■□□□ 1.13
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CTDSP2-207ENST00000551594 VCAM1P19320 739 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 ANTXR2P58335 489 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 IQCA1Q86XH1 822 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 F5H6K3 240 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 CYP2C8P10632 490 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 NT5C2P49902 561 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 KLRC3Q07444 240 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 NEK1Q96PY6 1258 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 GOPCQ9HD26 462 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 TNKSO95271 1327 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 ALDH1A1P00352 501 aa22.1■■□□□ 1.13
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CTDSP2-207ENST00000551594 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
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CTDSP2-207ENST00000551594 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 MTMR7Q9Y216 660 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 NDUFB10O96000 172 aa22.09■■□□□ 1.13
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CTDSP2-207ENST00000551594 CPA1P15085 419 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 MCCP23508 829 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 TTC14Q96N46 770 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 SENP2Q9HC62 589 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
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CTDSP2-207ENST00000551594 CA12O43570 354 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 PRC1O43663 620 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 MCM5P33992 734 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 KRT32Q14532 448 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 SEC23AQ15436 765 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDSP2-207ENST00000551594 CCDC178Q5BJE1 867 aa22.08■■□□□ 1.13
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CTDSP2-207ENST00000551594 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa22.08■■□□□ 1.13
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CTDSP2-207ENST00000551594 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDSP2-207ENST00000551594 USP17L11C9JVI0 530 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDSP2-207ENST00000551594 USP17L18D6R9N7 530 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDSP2-207ENST00000551594 USP17L22D6RA61 530 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDSP2-207ENST00000551594 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDSP2-207ENST00000551594 USP17L19D6RCP7 530 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDSP2-207ENST00000551594 USP17L20D6RJB6 530 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDSP2-207ENST00000551594 OSBPP22059 807 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDSP2-207ENST00000551594 USP17L24Q0WX57 530 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDSP2-207ENST00000551594 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
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CTDSP2-207ENST00000551594 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa22.07■■□□□ 1.12
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CTDSP2-207ENST00000551594 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
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CTDSP2-207ENST00000551594 TMEM67Q5HYA8 995 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDSP2-207ENST00000551594 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CTDSP2-207ENST00000551594 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
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CTDSP2-207ENST00000551594 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CTDSP2-207ENST00000551594 KAT14Q9H8E8 782 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDSP2-207ENST00000551594 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDSP2-207ENST00000551594 CPA4Q9UI42 421 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDSP2-207ENST00000551594 PNMA3Q9UL41 463 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDSP2-207ENST00000551594 RLFQ13129 1914 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-207ENST00000551594 ERICH2A1L162 156 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-207ENST00000551594 PEX10O60683 326 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-207ENST00000551594 WTAPQ15007 396 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-207ENST00000551594 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-207ENST00000551594 PNMA1Q8ND90 353 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-207ENST00000551594 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-207ENST00000551594 LY9Q9HBG7 655 aa22.04■■□□□ 1.12
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