RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549355.1

PTPRQ-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Q, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRQ, Length 567 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQ-204ENST00000549355 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 PREX2Q70Z35 1606 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 NPATQ14207 1427 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 MIA2Q96PC5 1412 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 BCORL1Q5H9F3 1711 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 FAM135AQ9P2D6 1515 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 SLITRK5O94991 958 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 RING1Q06587 406 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 SIGLEC10Q96LC7 697 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 FSHBP01225 129 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 MPSTP25325 297 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 EHHADHQ08426 723 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 FGD1P98174 961 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 TMEM132EQ6IEE7 984 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 ABCB6Q9NP58 842 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRQ-204ENST00000549355 A2MP01023 1474 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 CCDC141Q6ZP82 1450 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 HMGA2P52926 109 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 PPM1JQ5JR12 505 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 LILRA2Q8N149 483 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 STK35Q8TDR2 534 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 FBXO41Q8TF61 875 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 MYOM3Q5VTT5 1437 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 NCOA2Q15596 1464 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 LMTK3Q96Q04 1460 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 MADDQ8WXG6 1647 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 GRIN3BO60391 1043 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 CILPO75339 1184 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 SLPIP03973 132 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 ATP7AQ04656 1500 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 ZMYM3Q14202 1370 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 PDZD8Q8NEN9 1154 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 SHISA4Q96DD7 197 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 SYCP2Q9BX26 1530 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 ITSN2Q9NZM3 1697 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 ZSWIM5Q9P217 1185 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 IRAK3Q9Y616 596 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 MBD5Q9P267 1494 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 ADAM17P78536 824 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 NR0B2Q15466 257 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 GGT6Q6P531 493 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 ARMCX6Q7L4S7 300 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 TMEFF1Q8IYR6 380 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 GJD3Q8N144 294 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 TIAM1Q13009 1591 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 ZGLP1P0C6A0 271 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 NPR3P17342 541 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 EPHB3P54753 998 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 PTPRTO14522 1441 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 WASH4PA8MWX3 477 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 KIF3BO15066 747 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 USPL1Q5W0Q7 1092 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 KCNB2Q92953 911 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 ARHGEF5Q12774 1597 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 KANK1Q14678 1352 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 FZD6O60353 706 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 ZBTB37Q5TC79 503 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 TMEM164Q5U3C3 297 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRQ-204ENST00000549355 PLXNC1O60486 1568 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms