RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 CDC27P30260 824 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-216ENST00000549221 MCM2P49736 904 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-216ENST00000549221 MAP3K9P80192 1104 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-216ENST00000549221 DGKZQ13574 1117 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-216ENST00000549221 CUL4AQ13619 759 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-216ENST00000549221 SLC35G1Q2M3R5 365 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-216ENST00000549221 CCDC83Q8IWF9 413 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-216ENST00000549221 PNMA1Q8ND90 353 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-216ENST00000549221 GTF3C6Q969F1 213 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-216ENST00000549221 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CS-216ENST00000549221 KAT14Q9H8E8 782 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-216ENST00000549221 CABP5Q9NP86 173 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-216ENST00000549221 FOXD4L1Q9NU39 408 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-216ENST00000549221 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CS-216ENST00000549221 NYAP2Q9P242 653 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-216ENST00000549221 MTMR7Q9Y216 660 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-216ENST00000549221 SLC12A7Q9Y666 1083 aa9.54□□□□□ -0.88
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CS-216ENST00000549221 GOLGA8AA7E2F4 631 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-216ENST00000549221 USP17L5A8MUK1 530 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-216ENST00000549221 ZBTB43O43298 467 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-216ENST00000549221 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
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CS-216ENST00000549221 PPFIA3O75145 1194 aa9.53□□□□□ -0.88
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CS-216ENST00000549221 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CS-216ENST00000549221 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CS-216ENST00000549221 NF2P35240 595 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-216ENST00000549221 ADD1P35611 737 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CS-216ENST00000549221 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CS-216ENST00000549221 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
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CS-216ENST00000549221 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CS-216ENST00000549221 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-216ENST00000549221 IL27Q8NEV9 243 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-216ENST00000549221 NUP133Q8WUM0 1156 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-216ENST00000549221 MKL1Q969V6 931 aa9.53□□□□□ -0.88
CS-216ENST00000549221 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CS-216ENST00000549221 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CS-216ENST00000549221 PLEKHA8P1O95397 391 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-216ENST00000549221 NDUFB10O96000 172 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-216ENST00000549221 GOLGA8HP0CJ92 632 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-216ENST00000549221 SNHG28P0DPA3 235 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-216ENST00000549221 PDHBP11177 359 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-216ENST00000549221 GJA5P36382 358 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-216ENST00000549221 IREB2P48200 963 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CS-216ENST00000549221 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP9.52□□□□□ -0.896e-6■■■□□ 15.4
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CS-216ENST00000549221 GRM4Q14833 912 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-216ENST00000549221 RTN1Q16799 776 aa9.52□□□□□ -0.89
CS-216ENST00000549221 USP17L2Q6R6M4 530 aa9.52□□□□□ -0.89
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CS-216ENST00000549221 NBPF11Q86T75 865 aa9.52□□□□□ -0.89
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CS-216ENST00000549221 STAG2Q8N3U4 1231 aa9.52□□□□□ -0.89
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CS-216ENST00000549221 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
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CS-216ENST00000549221 MAD2L2Q9UI95 211 aa9.52□□□□□ -0.89
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CS-216ENST00000549221 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CS-216ENST00000549221 TRPM7Q96QT4 1865 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-216ENST00000549221 F5H6K3 240 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-216ENST00000549221 RCAN1P53805 252 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-216ENST00000549221 KLRC3Q07444 240 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-216ENST00000549221 FUT2Q10981 343 aa9.51□□□□□ -0.89
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CS-216ENST00000549221 ARMC9Q7Z3E5 817 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-216ENST00000549221 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa9.51□□□□□ -0.89
CS-216ENST00000549221 SPICE1Q8N0Z3 855 aa9.51□□□□□ -0.89
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CS-216ENST00000549221 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CS-216ENST00000549221 SPDYE5A6NIY4 337 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-216ENST00000549221 TRIM75PA6NK02 468 aa9.5□□□□□ -0.89
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CS-216ENST00000549221 RAD21O60216 631 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-216ENST00000549221 TOMM70O94826 608 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-216ENST00000549221 ZNF543Q08ER8 600 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-216ENST00000549221 SLFN13Q68D06 897 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-216ENST00000549221 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-216ENST00000549221 TMTC3Q6ZXV5 915 aa9.5□□□□□ -0.89
CS-216ENST00000549221 KCTD1Q719H9 257 aa9.5□□□□□ -0.89
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