RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546969.1

CASP9-211, Transcript of caspase 9, humanhuman

TSL 2

Gene CASP9, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9-211ENST00000546969 MB21D1Q8N884 522 aa20.23■□□□□ 0.83
CASP9-211ENST00000546969 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
CASP9-211ENST00000546969 GOPCQ9HD26 462 aa20.23■□□□□ 0.83
CASP9-211ENST00000546969 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa20.22■□□□□ 0.83
CASP9-211ENST00000546969 GPAA1O43292 621 aa20.22■□□□□ 0.83
CASP9-211ENST00000546969 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CASP9-211ENST00000546969 OSBP2Q969R2 916 aa20.22■□□□□ 0.83
CASP9-211ENST00000546969 SHISA4Q96DD7 197 aa20.22■□□□□ 0.83
CASP9-211ENST00000546969 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
CASP9-211ENST00000546969 TMX2Q9Y320 296 aa20.22■□□□□ 0.83
CASP9-211ENST00000546969 NR2E3Q9Y5X4 410 aa20.22■□□□□ 0.83
CASP9-211ENST00000546969 A0A1W2PRG0 241 aa20.21■□□□□ 0.83
CASP9-211ENST00000546969 SLC15A5A6NIM6 579 aa20.21■□□□□ 0.83
CASP9-211ENST00000546969 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CASP9-211ENST00000546969 RAD21O60216 631 aa20.21■□□□□ 0.83
CASP9-211ENST00000546969 FLOT1O75955 427 aa20.21■□□□□ 0.83
CASP9-211ENST00000546969 CHGBP05060 677 aa20.21■□□□□ 0.83
CASP9-211ENST00000546969 EVX2Q03828 476 aa20.21■□□□□ 0.83
CASP9-211ENST00000546969 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CASP9-211ENST00000546969 APBA2Q99767 749 aa20.21■□□□□ 0.83
CASP9-211ENST00000546969 PORCNQ9H237 461 aa20.21■□□□□ 0.83
CASP9-211ENST00000546969 VCPKMTQ9H867 229 aa20.21■□□□□ 0.83
CASP9-211ENST00000546969 CEP290O15078 2479 aa20.2■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 GSG1L2A8MUP6 293 aa20.2■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 WDR46O15213 610 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 PEX10O60683 326 aa20.2■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 MAP2K5Q13163 448 aa20.2■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 MFSD14CQ5VZR4 134 aa20.2■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 SLC5A4Q9NY91 659 aa20.2■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 EEF2P13639 858 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 PLS1Q14651 629 aa20.19■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 MORN1Q5T089 497 aa20.19■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 NECAB2Q7Z6G3 386 aa20.19■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 SPICE1Q8N0Z3 855 aa20.19■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 ANKLE1Q8NAG6 615 aa20.19■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 TRIB2Q92519 343 aa20.19■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 STRNO43815 780 aa20.18■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 CNMDO75829 334 aa20.18■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 PTPREP23469 700 aa20.18■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 DSG3P32926 999 aa20.18■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 PDE4BQ07343 736 aa20.18■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 PI4K2BQ8TCG2 481 aa20.18■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 NAPBQ9H115 298 aa20.18■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 DPP9Q86TI2 863 aa20.17■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 STK11IPQ8N1F8 1099 aa20.17■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 EVI5LQ96CN4 794 aa20.17■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 SPATC1LQ9H0A9 340 aa20.17■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa20.17■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 BTBD7Q9P203 1132 aa20.17■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 M0R2C6 588 aa20.16■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa20.16■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 IFNL3Q8IZI9 196 aa20.16■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 SHCBP1Q8NEM2 672 aa20.16■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 USP6NLQ92738 828 aa20.16■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 MROH8Q9H579 483 aa20.16■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 EVI5O60447 810 aa20.15■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 SLC34A2O95436 690 aa20.15■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 SLC25A27O95847 323 aa20.15■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa20.15■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 CLEC10AQ8IUN9 316 aa20.15■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 BRCA2P51587 3418 aa20.14■□□□□ 0.82
CASP9-211ENST00000546969 ROBO3Q96MS0 1386 aa20.14■□□□□ 0.81
CASP9-211ENST00000546969 H0YGN5 161 aa20.14■□□□□ 0.81
CASP9-211ENST00000546969 RASA1P20936 1047 aa20.14■□□□□ 0.81
CASP9-211ENST00000546969 COPB2P35606 906 aa20.14■□□□□ 0.81
CASP9-211ENST00000546969 TRIM32Q13049 653 aa20.14■□□□□ 0.81
CASP9-211ENST00000546969 GRB14Q14449 540 aa20.14■□□□□ 0.81
CASP9-211ENST00000546969 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa20.14■□□□□ 0.81
CASP9-211ENST00000546969 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa20.14■□□□□ 0.81
CASP9-211ENST00000546969 NCAPG2Q86XI2 1143 aa20.14■□□□□ 0.81
CASP9-211ENST00000546969 TICAM2Q86XR7 235 aa20.14■□□□□ 0.81
CASP9-211ENST00000546969 SIAH1Q8IUQ4 282 aa20.14■□□□□ 0.81
CASP9-211ENST00000546969 NBPF3Q9H094 633 aa20.14■□□□□ 0.81
CASP9-211ENST00000546969 NYAP2Q9P242 653 aa20.14■□□□□ 0.81
CASP9-211ENST00000546969 STAP2Q9UGK3 403 aa20.14■□□□□ 0.81
CASP9-211ENST00000546969 TSPY3P0CV98 308 aa20.13■□□□□ 0.81
CASP9-211ENST00000546969 TSPY8P0CW00 308 aa20.13■□□□□ 0.81
CASP9-211ENST00000546969 ERCC3P19447 782 aa20.13■□□□□ 0.81
CASP9-211ENST00000546969 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CASP9-211ENST00000546969 POTEEQ6S8J3 1075 aa20.13■□□□□ 0.81
CASP9-211ENST00000546969 ATG4CQ96DT6 458 aa20.13■□□□□ 0.81
CASP9-211ENST00000546969 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CASP9-211ENST00000546969 PLXNB2O15031 1838 aa20.12■□□□□ 0.81
CASP9-211ENST00000546969 SMIM22K7EJ46 135 aa20.12■□□□□ 0.81
CASP9-211ENST00000546969 MSCO60682 206 aa20.12■□□□□ 0.81
CASP9-211ENST00000546969 HOXC6P09630 235 aa20.12■□□□□ 0.81
CASP9-211ENST00000546969 FCER1AP12319 257 aa20.12■□□□□ 0.81
CASP9-211ENST00000546969 PDE1AP54750 535 aa20.12■□□□□ 0.81
CASP9-211ENST00000546969 CCL14Q16627 93 aa20.12■□□□□ 0.81
CASP9-211ENST00000546969 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CASP9-211ENST00000546969 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms