RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538020.1

LMO3-218, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 622 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-218ENST00000538020 CCT2P78371 535 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
LMO3-218ENST00000538020 SCRN1Q12765 414 aa13.97□□□□□ -0.17
LMO3-218ENST00000538020 TROAPQ12815 778 aa13.97□□□□□ -0.17
LMO3-218ENST00000538020 RTN1Q16799 776 aa13.97□□□□□ -0.17
LMO3-218ENST00000538020 CCDC83Q8IWF9 413 aa13.97□□□□□ -0.17
LMO3-218ENST00000538020 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
LMO3-218ENST00000538020 NECAB1Q8N987 351 aa13.97□□□□□ -0.17
LMO3-218ENST00000538020 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
LMO3-218ENST00000538020 MYL10Q9BUA6 226 aa13.97□□□□□ -0.17
LMO3-218ENST00000538020 ZNF408Q9H9D4 720 aa13.97□□□□□ -0.17
LMO3-218ENST00000538020 GOPCQ9HD26 462 aa13.97□□□□□ -0.17
LMO3-218ENST00000538020 HPS5Q9UPZ3 1129 aa13.97□□□□□ -0.17
LMO3-218ENST00000538020 TRPM7Q96QT4 1865 aa13.96□□□□□ -0.17
LMO3-218ENST00000538020 KIF3CO14782 793 aa13.96□□□□□ -0.17
LMO3-218ENST00000538020 CDKL5O76039 1030 aa13.96□□□□□ -0.17
LMO3-218ENST00000538020 PTPRAP18433 802 aa13.96□□□□□ -0.17
LMO3-218ENST00000538020 GNAQP50148 359 aa13.96□□□□□ -0.17
LMO3-218ENST00000538020 VGLL4Q14135 290 aa13.96□□□□□ -0.17
LMO3-218ENST00000538020 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
LMO3-218ENST00000538020 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa13.96□□□□□ -0.17
LMO3-218ENST00000538020 C2orf69Q8N8R5 385 aa13.96□□□□□ -0.17
LMO3-218ENST00000538020 FANCBQ8NB91 859 aa13.96□□□□□ -0.17
LMO3-218ENST00000538020 SMC1BQ8NDV3 1235 aa13.96□□□□□ -0.17
LMO3-218ENST00000538020 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa13.96□□□□□ -0.17
LMO3-218ENST00000538020 FEZ1Q99689 392 aa13.96□□□□□ -0.17
LMO3-218ENST00000538020 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
LMO3-218ENST00000538020 FZD1Q9UP38 647 aa13.96□□□□□ -0.17
LMO3-218ENST00000538020 TMX2Q9Y320 296 aa13.96□□□□□ -0.17
LMO3-218ENST00000538020 CELF2O95319 508 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 RXRAP19793 462 aa13.95□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 GRM4Q14833 912 aa13.95□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 ASPRV1Q53RT3 343 aa13.95□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 SIAH1Q8IUQ4 282 aa13.95□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa13.95□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 DCAF4Q8WV16 495 aa13.95□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 WDR18Q9BV38 432 aa13.95□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 MTMR7Q9Y216 660 aa13.95□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa13.95□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 SNHG28P0DPA3 235 aa13.94□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 PDHBP11177 359 aa13.94□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 USP14P54578 494 aa13.94□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 ST3GAL1Q11201 340 aa13.94□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 SLFN13Q68D06 897 aa13.94□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 ZNF280CQ8ND82 737 aa13.94□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 ACER1Q8TDN7 264 aa13.94□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 LZTS2Q9BRK4 669 aa13.94□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa13.94□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 VCPKMTQ9H867 229 aa13.94□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 SMC3Q9UQE7 1217 aa13.94□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 KIF3AQ9Y496 699 aa13.94□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 PHIPQ8WWQ0 1821 aa13.93□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 A0A1W2PRG0 241 aa13.93□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 USP17L10C9JJH3 530 aa13.93□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 F5H6K3 240 aa13.93□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 RAD21O60216 631 aa13.93□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 TOMM70O94826 608 aa13.93□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 CDC27P30260 824 aa13.93□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 ECE1P42892 770 aa13.93□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 SLC1A4P43007 532 aa13.93□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 SLC4A3P48751 1232 aa13.93□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 KLRC3Q07444 240 aa13.93□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 ZNF543Q08ER8 600 aa13.93□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 CCDC96Q2M329 555 aa13.93□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 LDLRAD1Q5T700 205 aa13.93□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 ERO1BQ86YB8 467 aa13.93□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 LPAR1Q92633 364 aa13.93□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 GMCL1Q96IK5 515 aa13.93□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 ZHX2Q9Y6X8 837 aa13.93□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 SPDYE5A6NIY4 337 aa13.92□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 C19orf81C9J6K1 198 aa13.92□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 UBE2Q2LH0YL09 131 aa13.92□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 NDUFB10O96000 172 aa13.92□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 IFNAR1P17181 557 aa13.92□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 ADD1P35611 737 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 PPATQ06203 517 aa13.92□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP13.92□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 TMTC3Q6ZXV5 915 aa13.92□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 MOB2Q70IA6 237 aa13.92□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 TRIM22Q8IYM9 498 aa13.92□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa13.92□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 ELP3Q9H9T3 547 aa13.92□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 FOXD4L1Q9NU39 408 aa13.92□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 MAD2L2Q9UI95 211 aa13.92□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 PASKQ96RG2 1323 aa13.91□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 STK36Q9NRP7 1315 aa13.91□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 PTPDC1A2A3K4 754 aa13.91□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 KLRF2D3W0D1 207 aa13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 106 ms