RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 GOPCQ9HD26 462 aa26.03■■□□□ 1.76
PTPRK-222ENST00000532751 CTNNA3Q9UI47 895 aa26.03■■□□□ 1.76
PTPRK-222ENST00000532751 ORC4O43929 436 aa26.02■■□□□ 1.76
PTPRK-222ENST00000532751 PCP11498 1178 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
PTPRK-222ENST00000532751 HERVK_113P62684 666 aa26.02■■□□□ 1.76
PTPRK-222ENST00000532751 FAM47AQ5JRC9 791 aa26.02■■□□□ 1.76
PTPRK-222ENST00000532751 ABHD8Q96I13 439 aa26.02■■□□□ 1.76
PTPRK-222ENST00000532751 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
PTPRK-222ENST00000532751 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRK-222ENST00000532751 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
PTPRK-222ENST00000532751 FGRP09769 529 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRK-222ENST00000532751 PSMC4P43686 418 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRK-222ENST00000532751 MFSD6Q6ZSS7 791 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRK-222ENST00000532751 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRK-222ENST00000532751 IL25Q9H293 177 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRK-222ENST00000532751 WDR46O15213 610 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
PTPRK-222ENST00000532751 RAD21O60216 631 aa26■■□□□ 1.75
PTPRK-222ENST00000532751 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
PTPRK-222ENST00000532751 TTLL1O95922 423 aa26■■□□□ 1.75
PTPRK-222ENST00000532751 HOXD10P28358 340 aa26■■□□□ 1.75
PTPRK-222ENST00000532751 FCGRTP55899 365 aa26■■□□□ 1.75
PTPRK-222ENST00000532751 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
PTPRK-222ENST00000532751 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
PTPRK-222ENST00000532751 AKNAD1Q5T1N1 836 aa26■■□□□ 1.75
PTPRK-222ENST00000532751 CEP95Q96GE4 821 aa26■■□□□ 1.75
PTPRK-222ENST00000532751 TANGO6Q9C0B7 1094 aa26■■□□□ 1.75
PTPRK-222ENST00000532751 INCENPQ9NQS7 918 aa26■■□□□ 1.75
PTPRK-222ENST00000532751 MTMR4Q9NYA4 1195 aa26■■□□□ 1.75
PTPRK-222ENST00000532751 CLIP2Q9UDT6 1046 aa26■■□□□ 1.75
PTPRK-222ENST00000532751 SGSM2O43147 1006 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRK-222ENST00000532751 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
PTPRK-222ENST00000532751 SPICE1Q8N0Z3 855 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRK-222ENST00000532751 STAG1Q8WVM7 1258 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRK-222ENST00000532751 PTPN22Q9Y2R2 807 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRK-222ENST00000532751 PRMT2P55345 433 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRK-222ENST00000532751 CAP1Q01518 475 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRK-222ENST00000532751 MORF4L1Q9UBU8 362 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRK-222ENST00000532751 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRK-222ENST00000532751 TACC3Q9Y6A5 838 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRK-222ENST00000532751 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRK-222ENST00000532751 MKL1Q969V6 931 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRK-222ENST00000532751 HOXC10Q9NYD6 342 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRK-222ENST00000532751 NT5C2P49902 561 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRK-222ENST00000532751 COG2Q14746 738 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRK-222ENST00000532751 TBC1D10CQ8IV04 446 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRK-222ENST00000532751 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRK-222ENST00000532751 TRIM47Q96LD4 638 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRK-222ENST00000532751 PAGR1Q9BTK6 254 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRK-222ENST00000532751 PARP14Q460N5 1801 aa25.95■■□□□ 1.75
PTPRK-222ENST00000532751 CTGFP29279 349 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 CASC1Q6TDU7 716 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 LBX2Q6XYB7 198 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 NBPF3Q9H094 633 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 RBPJLQ9UBG7 517 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 STX8Q9UNK0 236 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 HPS5Q9UPZ3 1129 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa25.95■■□□□ 1.74
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PTPRK-222ENST00000532751 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 F5H6K3 240 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 FLOT1O75955 427 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 KLRC3Q07444 240 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 ESR2Q92731 530 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 SRRDQ9UH36 339 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 MYPNQ86TC9 1320 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 ERVK-9P63128 1117 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 ERVK-24P63145 666 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 IFFO2Q5TF58 517 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 COA7Q96BR5 231 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 TXNRD2Q9NNW7 524 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 DOCK3Q8IZD9 2030 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 NDUFB10O96000 172 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 DSG3P32926 999 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 CCNA1P78396 465 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 PTH1RQ03431 593 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 FAM83BQ5T0W9 1011 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 IL17RBQ9NRM6 502 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 NEDD4P46934 1319 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 CCDC85CA6NKD9 419 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 NMT2O60551 498 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 CDC45O75419 566 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 KRT23Q9C075 422 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 CNNM2Q9H8M5 875 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 A0A0G2JMZ2 1700 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 CAPN15O75808 1086 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 SLFN13Q68D06 897 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 MB21D1Q8N884 522 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 RAET1EQ8TD07 263 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 PEX10O60683 326 aa25.89■■□□□ 1.74
PTPRK-222ENST00000532751 CNMDO75829 334 aa25.89■■□□□ 1.74
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