RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528118.5

TMPRSS4-217, Transcript of transmembrane serine protease 4, humanhuman

TSL 2

Gene TMPRSS4, Length 3,838 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4-217ENST00000528118 USP49Q70CQ1 688 aa9.48□□□□□ -0.89
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TMPRSS4-217ENST00000528118 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
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