RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521962.1

HACE1-211, Transcript of HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 4

Gene HACE1, Length 561 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1-211ENST00000521962 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
HACE1-211ENST00000521962 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa19.57■□□□□ 0.72
HACE1-211ENST00000521962 CPA4Q9UI42 421 aa19.57■□□□□ 0.72
HACE1-211ENST00000521962 TAF6LQ9Y6J9 622 aa19.57■□□□□ 0.72
HACE1-211ENST00000521962 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa19.56■□□□□ 0.72
HACE1-211ENST00000521962 ZNF213O14771 459 aa19.56■□□□□ 0.72
HACE1-211ENST00000521962 NMT2O60551 498 aa19.56■□□□□ 0.72
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HACE1-211ENST00000521962 TSPY8P0CW00 308 aa19.56■□□□□ 0.72
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HACE1-211ENST00000521962 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
HACE1-211ENST00000521962 MFSD6Q6ZSS7 791 aa19.54■□□□□ 0.72
HACE1-211ENST00000521962 SPICE1Q8N0Z3 855 aa19.54■□□□□ 0.72
HACE1-211ENST00000521962 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
HACE1-211ENST00000521962 SH2D4AQ9H788 454 aa19.54■□□□□ 0.72
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HACE1-211ENST00000521962 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
HACE1-211ENST00000521962 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
HACE1-211ENST00000521962 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa19.54■□□□□ 0.72
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HACE1-211ENST00000521962 NOVP48745 357 aa19.53■□□□□ 0.72
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HACE1-211ENST00000521962 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP19.53■□□□□ 0.72
HACE1-211ENST00000521962 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
HACE1-211ENST00000521962 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
HACE1-211ENST00000521962 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
HACE1-211ENST00000521962 EFCC1Q9HA90 598 aa19.53■□□□□ 0.72
HACE1-211ENST00000521962 TOMM22Q9NS69 142 aa19.53■□□□□ 0.72
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HACE1-211ENST00000521962 HERVK_113P62684 666 aa19.52■□□□□ 0.72
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HACE1-211ENST00000521962 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa19.52■□□□□ 0.72
HACE1-211ENST00000521962 STOX1Q6ZVD7 989 aa19.52■□□□□ 0.72
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HACE1-211ENST00000521962 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa19.52■□□□□ 0.72
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HACE1-211ENST00000521962 USP17L11C9JVI0 530 aa19.51■□□□□ 0.71
HACE1-211ENST00000521962 USP17L18D6R9N7 530 aa19.51■□□□□ 0.71
HACE1-211ENST00000521962 USP17L22D6RA61 530 aa19.51■□□□□ 0.71
HACE1-211ENST00000521962 USP17L17D6RBQ6 530 aa19.51■□□□□ 0.71
HACE1-211ENST00000521962 USP17L19D6RCP7 530 aa19.51■□□□□ 0.71
HACE1-211ENST00000521962 USP17L20D6RJB6 530 aa19.51■□□□□ 0.71
HACE1-211ENST00000521962 USP17L24Q0WX57 530 aa19.51■□□□□ 0.71
HACE1-211ENST00000521962 TXNRD2Q9NNW7 524 aa19.51■□□□□ 0.71
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HACE1-211ENST00000521962 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
HACE1-211ENST00000521962 B4E1Z4 1266 aa19.5■□□□□ 0.71
HACE1-211ENST00000521962 WDR46O15213 610 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
HACE1-211ENST00000521962 KDM4AO75164 1064 aa19.5■□□□□ 0.71
HACE1-211ENST00000521962 NDUFB10O96000 172 aa19.5■□□□□ 0.71
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HACE1-211ENST00000521962 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa19.5■□□□□ 0.71
HACE1-211ENST00000521962 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
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HACE1-211ENST00000521962 FAM110CQ1W6H9 321 aa19.49■□□□□ 0.71
HACE1-211ENST00000521962 CASC1Q6TDU7 716 aa19.49■□□□□ 0.71
HACE1-211ENST00000521962 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa19.49■□□□□ 0.71
HACE1-211ENST00000521962 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa19.49■□□□□ 0.71
HACE1-211ENST00000521962 ESR2Q92731 530 aa19.49■□□□□ 0.71
HACE1-211ENST00000521962 TANGO6Q9C0B7 1094 aa19.49■□□□□ 0.71
HACE1-211ENST00000521962 MORF4L1Q9UBU8 362 aa19.49■□□□□ 0.71
HACE1-211ENST00000521962 STX8Q9UNK0 236 aa19.49■□□□□ 0.71
HACE1-211ENST00000521962 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
HACE1-211ENST00000521962 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
HACE1-211ENST00000521962 NECTIN1Q15223 517 aa19.48■□□□□ 0.71
HACE1-211ENST00000521962 FAM83BQ5T0W9 1011 aa19.48■□□□□ 0.71
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