RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513272.5

TMA16-209, Transcript of translation machinery associated 16 homolog, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMA16, Length 803 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMA16-209ENST00000513272 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.75■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 SH2D4AQ9H788 454 aa22.75■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 TMX2Q9Y320 296 aa22.75■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 RPTORQ8N122 1335 aa22.75■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 PLXNB2O15031 1838 aa22.74■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 M0R2C6 588 aa22.74■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 GPAA1O43292 621 aa22.74■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 MX1P20591 662 aa22.74■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 RGS2P41220 211 aa22.74■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 ATP2B2Q01814 1243 aa22.74■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 SBK1Q52WX2 424 aa22.74■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.74■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 GIMAP6Q6P9H5 292 aa22.74■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.74■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 LPAR1Q92633 364 aa22.74■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 USP6NLQ92738 828 aa22.74■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa22.74■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.74■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.73■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 APPP05067 770 aa22.73■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 CAPN2P17655 700 aa22.73■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 FSD1Q9BTV5 496 aa22.73■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 HTATIP2Q9BUP3 242 aa22.73■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 VCPKMTQ9H867 229 aa22.73■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.73■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 H0YGN5 161 aa22.72■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 GNAT2P19087 354 aa22.72■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 CCL14Q16627 93 aa22.72■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 APBA2Q99767 749 aa22.72■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa22.72■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 MYH8P13535 1937 aa22.72■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 FLOT1O75955 427 aa22.71■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 TDO2P48775 406 aa22.71■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 MAP2K5Q13163 448 aa22.71■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa22.71■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.71■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
TMA16-209ENST00000513272 PTPREP23469 700 aa22.7■■□□□ 1.22
TMA16-209ENST00000513272 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
TMA16-209ENST00000513272 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
TMA16-209ENST00000513272 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.69■■□□□ 1.22
TMA16-209ENST00000513272 SLC15A5A6NIM6 579 aa22.69■■□□□ 1.22
TMA16-209ENST00000513272 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
TMA16-209ENST00000513272 WDR46O15213 610 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
TMA16-209ENST00000513272 RAD21O60216 631 aa22.69■■□□□ 1.22
TMA16-209ENST00000513272 RASA1P20936 1047 aa22.69■■□□□ 1.22
TMA16-209ENST00000513272 DSG3P32926 999 aa22.69■■□□□ 1.22
TMA16-209ENST00000513272 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
TMA16-209ENST00000513272 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
TMA16-209ENST00000513272 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.69■■□□□ 1.22
TMA16-209ENST00000513272 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
TMA16-209ENST00000513272 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.68■■□□□ 1.22
TMA16-209ENST00000513272 PLS1Q14651 629 aa22.68■■□□□ 1.22
TMA16-209ENST00000513272 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
TMA16-209ENST00000513272 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.68■■□□□ 1.22
TMA16-209ENST00000513272 MB21D1Q8N884 522 aa22.68■■□□□ 1.22
TMA16-209ENST00000513272 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
TMA16-209ENST00000513272 ATG4CQ96DT6 458 aa22.68■■□□□ 1.22
TMA16-209ENST00000513272 SPATC1LQ9H0A9 340 aa22.68■■□□□ 1.22
TMA16-209ENST00000513272 GOPCQ9HD26 462 aa22.68■■□□□ 1.22
TMA16-209ENST00000513272 GRB14Q14449 540 aa22.67■■□□□ 1.22
TMA16-209ENST00000513272 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.67■■□□□ 1.22
TMA16-209ENST00000513272 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.67■■□□□ 1.22
TMA16-209ENST00000513272 CEP290O15078 2479 aa22.66■■□□□ 1.22
TMA16-209ENST00000513272 NECAB2Q7Z6G3 386 aa22.66■■□□□ 1.22
TMA16-209ENST00000513272 ANKLE1Q8NAG6 615 aa22.66■■□□□ 1.22
TMA16-209ENST00000513272 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.66■■□□□ 1.22
TMA16-209ENST00000513272 FLRT1Q9NZU1 646 aa22.66■■□□□ 1.22
TMA16-209ENST00000513272 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
TMA16-209ENST00000513272 PRDM1O75626 825 aa22.65■■□□□ 1.22
TMA16-209ENST00000513272 ERCC3P19447 782 aa22.65■■□□□ 1.22
TMA16-209ENST00000513272 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
TMA16-209ENST00000513272 MFSD14CQ5VZR4 134 aa22.65■■□□□ 1.22
TMA16-209ENST00000513272 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
TMA16-209ENST00000513272 SHCBP1Q8NEM2 672 aa22.65■■□□□ 1.22
TMA16-209ENST00000513272 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.65■■□□□ 1.22
TMA16-209ENST00000513272 OGDHLQ9ULD0 1010 aa22.65■■□□□ 1.22
TMA16-209ENST00000513272 NR2E3Q9Y5X4 410 aa22.65■■□□□ 1.22
TMA16-209ENST00000513272 STRNO43815 780 aa22.64■■□□□ 1.21
TMA16-209ENST00000513272 EVI5O60447 810 aa22.64■■□□□ 1.21
TMA16-209ENST00000513272 HOXC6P09630 235 aa22.64■■□□□ 1.21
TMA16-209ENST00000513272 PDE1AP54750 535 aa22.64■■□□□ 1.21
TMA16-209ENST00000513272 AAMPQ13685 434 aa22.64■■□□□ 1.21
TMA16-209ENST00000513272 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.64■■□□□ 1.21
TMA16-209ENST00000513272 DPP9Q86TI2 863 aa22.64■■□□□ 1.21
TMA16-209ENST00000513272 NCAPG2Q86XI2 1143 aa22.64■■□□□ 1.21
TMA16-209ENST00000513272 NPLOC4Q8TAT6 608 aa22.64■■□□□ 1.21
TMA16-209ENST00000513272 NAPBQ9H115 298 aa22.64■■□□□ 1.21
TMA16-209ENST00000513272 NYAP2Q9P242 653 aa22.64■■□□□ 1.21
TMA16-209ENST00000513272 STAP2Q9UGK3 403 aa22.64■■□□□ 1.21
TMA16-209ENST00000513272 RLFQ13129 1914 aa22.64■■□□□ 1.21
TMA16-209ENST00000513272 ADORA2AP29274 412 aa22.63■■□□□ 1.21
TMA16-209ENST00000513272 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms