RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
HERC3-210ENST00000512194 LRRC4BQ9NT99 713 aa9.38□□□□□ -0.91
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HERC3-210ENST00000512194 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
HERC3-210ENST00000512194 PWP1Q13610 501 aa9.37□□□□□ -0.91
HERC3-210ENST00000512194 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
HERC3-210ENST00000512194 NBPF6Q5VWK0 638 aa9.37□□□□□ -0.91
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HERC3-210ENST00000512194 NBPF4Q96M43 638 aa9.37□□□□□ -0.91
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HERC3-210ENST00000512194 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
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HERC3-210ENST00000512194 STARD13Q9Y3M8 1113 aa9.35□□□□□ -0.91
HERC3-210ENST00000512194 IL16Q14005 1332 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-210ENST00000512194 GNAT3A8MTJ3 354 aa9.34□□□□□ -0.91
HERC3-210ENST00000512194 HSPA6P17066 643 aa9.34□□□□□ -0.91
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HERC3-210ENST00000512194 C5P01031 1676 aa9.33□□□□□ -0.92
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HERC3-210ENST00000512194 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa9.32□□□□□ -0.92
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HERC3-210ENST00000512194 IL2RBP14784 551 aa9.32□□□□□ -0.92
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HERC3-210ENST00000512194 SLFN5Q08AF3 891 aa9.32□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 FAAP100Q0VG06 881 aa9.32□□□□□ -0.92
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HERC3-210ENST00000512194 SAMM50Q9Y512 469 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 UBR3Q6ZT12 1888 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 NCAPD2Q15021 1401 aa9.31□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 CELA3AP09093 270 aa9.3□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
HERC3-210ENST00000512194 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
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