RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FSD1Q9BTV5 496 aa27.94■■■□□ 2.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP27.94■■■□□ 2.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HOXC10Q9NYD6 342 aa27.94■■■□□ 2.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMX2Q9Y320 296 aa27.94■■■□□ 2.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 M0R2C6 588 aa27.93■■■□□ 2.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GNAT2P19087 354 aa27.93■■■□□ 2.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRIM32Q13049 653 aa27.93■■■□□ 2.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRIB2Q92519 343 aa27.93■■■□□ 2.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BTBD7Q9P203 1132 aa27.93■■■□□ 2.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RGS2P41220 211 aa27.92■■■□□ 2.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TDO2P48775 406 aa27.92■■■□□ 2.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa27.92■■■□□ 2.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SPICE1Q8N0Z3 855 aa27.92■■■□□ 2.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LPAR1Q92633 364 aa27.92■■■□□ 2.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DPF3Q92784 378 aa27.92■■■□□ 2.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GCC1Q96CN9 775 aa27.92■■■□□ 2.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KANSL2Q9H9L4 492 aa27.92■■■□□ 2.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MKNK2Q9HBH9 465 aa27.92■■■□□ 2.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RPTORQ8N122 1335 aa27.92■■■□□ 2.06
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 CAPN2P17655 700 aa27.91■■■□□ 2.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MORN1Q5T089 497 aa27.91■■■□□ 2.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 VCPKMTQ9H867 229 aa27.91■■■□□ 2.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa27.9■■■□□ 2.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 USP6NLQ92738 828 aa27.9■■■□□ 2.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HTATIP2Q9BUP3 242 aa27.9■■■□□ 2.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa27.9■■■□□ 2.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RAD21O60216 631 aa27.88■■■□□ 2.05
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FLOT1O75955 427 aa27.88■■■□□ 2.05
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAP2K5Q13163 448 aa27.88■■■□□ 2.05
HOXC-AS1-201ENST00000505700 APBA2Q99767 749 aa27.88■■■□□ 2.05
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa27.88■■■□□ 2.05
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC15A5A6NIM6 579 aa27.87■■■□□ 2.05
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WDR46O15213 610 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PTPREP23469 700 aa27.87■■■□□ 2.05
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AAMPQ13685 434 aa27.87■■■□□ 2.05
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCL14Q16627 93 aa27.87■■■□□ 2.05
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IFNL3Q8IZI9 196 aa27.87■■■□□ 2.05
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NACAP1Q9BZK3 213 aa27.87■■■□□ 2.05
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RASA1P20936 1047 aa27.86■■■□□ 2.05
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DSG3P32926 999 aa27.86■■■□□ 2.05
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa27.86■■■□□ 2.05
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF287Q9HBT7 754 aa27.86■■■□□ 2.05
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 SALL3Q9BXA9 1300 aa27.86■■■□□ 2.05
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 PLS1Q14651 629 aa27.85■■■□□ 2.05
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MB21D1Q8N884 522 aa27.85■■■□□ 2.05
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC34A2O95436 690 aa27.84■■■□□ 2.05
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 ATG4CQ96DT6 458 aa27.84■■■□□ 2.05
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SPATC1LQ9H0A9 340 aa27.84■■■□□ 2.05
HOXC-AS1-201ENST00000505700 STAP2Q9UGK3 403 aa27.84■■■□□ 2.05
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RLFQ13129 1914 aa27.84■■■□□ 2.05
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ROBO3Q96MS0 1386 aa27.84■■■□□ 2.05
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 EVI5LQ96CN4 794 aa27.83■■■□□ 2.05
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRDM1O75626 825 aa27.82■■■□□ 2.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GRB14Q14449 540 aa27.82■■■□□ 2.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ERCC3P19447 782 aa27.81■■■□□ 2.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MFSD14CQ5VZR4 134 aa27.81■■■□□ 2.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NECAB2Q7Z6G3 386 aa27.81■■■□□ 2.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ANKLE1Q8NAG6 615 aa27.81■■■□□ 2.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SHCBP1Q8NEM2 672 aa27.81■■■□□ 2.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NYAP2Q9P242 653 aa27.81■■■□□ 2.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 STRNO43815 780 aa27.8■■■□□ 2.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM83BQ5T0W9 1011 aa27.8■■■□□ 2.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa27.8■■■□□ 2.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DPP9Q86TI2 863 aa27.8■■■□□ 2.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NCAPG2Q86XI2 1143 aa27.8■■■□□ 2.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LNPKQ9C0E8 428 aa27.8■■■□□ 2.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FBXO28Q9NVF7 368 aa27.8■■■□□ 2.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NR2E3Q9Y5X4 410 aa27.8■■■□□ 2.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A0A0G2JMZ2 1700 aa27.79■■■□□ 2.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PDE4BQ07343 736 aa27.79■■■□□ 2.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa27.79■■■□□ 2.04
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