RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498054.1

POLR1B-215, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1B, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-215ENST00000498054 EEPD1Q7L9B9 569 aa6.37□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa6.37□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 TOP6BLQ8N6T0 577 aa6.37□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 GIMAP7Q8NHV1 300 aa6.37□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 PPP1R14AQ96A00 147 aa6.37□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.37□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 SLITRK5O94991 958 aa6.36□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 ETV3P41162 512 aa6.36□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 PMS1P54277 932 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 PRR23CQ6ZRP0 262 aa6.36□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 LRP10Q7Z4F1 713 aa6.36□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 CLEC10AQ8IUN9 316 aa6.36□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 STOML1Q9UBI4 398 aa6.36□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.36□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 HMX2A2RU54 273 aa6.35□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 C9IYK1 514 aa6.35□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 FAM87AP0C7U9 286 aa6.35□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 RASGRF1Q13972 1273 aa6.35□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 SV2CQ496J9 727 aa6.35□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 PPFIBP1Q86W92 1011 aa6.35□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 FBXL6Q8N531 539 aa6.35□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa6.35□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 KREMEN1Q96MU8 473 aa6.35□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 TBC1D32Q96NH3 1257 aa6.35□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.35□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 C1GALT1Q9NS00 363 aa6.35□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 LRP2BPQ9P2M1 347 aa6.35□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 FBXL21Q9UKT6 434 aa6.35□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 CECR2Q9BXF3 1484 aa6.34□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 LEFTY1O75610 366 aa6.34□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 CYP7A1P22680 504 aa6.34□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 RNF4P78317 190 aa6.34□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 SDE2Q6IQ49 451 aa6.34□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.34□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 DNAJB8Q8NHS0 232 aa6.34□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 KLHL6Q8WZ60 621 aa6.34□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 FAM83CQ9BQN1 747 aa6.34□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 DUSP23Q9BVJ7 150 aa6.34□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 RNF112Q9ULX5 631 aa6.34□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 RAXQ9Y2V3 346 aa6.34□□□□□ -1.39
POLR1B-215ENST00000498054 SUSD5O60279 629 aa6.33□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 CBX7O95931 251 aa6.33□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 NAT2P11245 290 aa6.33□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 TCEAL1Q15170 157 aa6.33□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 DCAF15Q66K64 600 aa6.33□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa6.33□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 SPATC1Q76KD6 591 aa6.33□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 FGD4Q96M96 766 aa6.33□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 MFSD14AQ96MC6 490 aa6.33□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 APBA2Q99767 749 aa6.33□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.33□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa6.33□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 TBX22Q9Y458 520 aa6.33□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 KDM2BQ8NHM5 1336 aa6.32□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 ANKRD34BA5PLL1 514 aa6.32□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 AGRPO00253 132 aa6.32□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 EPHX1P07099 455 aa6.32□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa6.32□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 LILRB2Q8N423 598 aa6.32□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 SH3TC2Q8TF17 1288 aa6.32□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 HAUS7Q99871 368 aa6.32□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.31□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 IQCA1LA6NCM1 817 aa6.31□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 LRRN2O75325 713 aa6.31□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 CLSTN1O94985 981 aa6.31□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 EOMESO95936 686 aa6.31□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 FSTP19883 344 aa6.31□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 ADMP35318 185 aa6.31□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 AUHQ13825 339 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.31□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 C7orf61Q8IZ16 206 aa6.31□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 RNF141Q8WVD5 230 aa6.31□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 ASPNQ9BXN1 380 aa6.31□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 GBP3Q9H0R5 595 aa6.31□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa6.31□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 ZMYM5Q9UJ78 669 aa6.31□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa6.31□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 CADPSQ9ULU8 1353 aa6.31□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 FAM170BA6NMN3 283 aa6.3□□□□□ -1.4
POLR1B-215ENST00000498054 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa6.3□□□□□ -1.4
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