RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497230.2

PRRX1-207, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRRX1, Length 3,501 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-207ENST00000497230 KRT14P02533 472 aa13.41□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 PLCD1P51178 756 aa13.41□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 VAV2P52735 878 aa13.41□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 C8orf74Q6P047 294 aa13.41□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 CPLX4Q7Z7G2 160 aa13.41□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 NOSTRINQ8IVI9 506 aa13.41□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 COG1Q8WTW3 980 aa13.41□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 ABCF2Q9UG63 623 aa13.41□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa13.4□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 PPFIA1Q13136 1202 aa13.4□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 TYW1BQ6NUM6 668 aa13.4□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 KAT2BQ92831 832 aa13.4□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 HPCAL4Q9UM19 191 aa13.4□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 KANK3Q6NY19 840 aa13.4□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 NELFBQ8WX92 580 aa13.4□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 DUSP10Q9Y6W6 482 aa13.4□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 KIF4AO95239 1232 aa13.4□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 NDUFA10O95299 355 aa13.4□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 APBA1Q02410 837 aa13.4□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 IFFO1Q0D2I5 559 aa13.4□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa13.4□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 MIGA1Q8NAN2 632 aa13.4□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 OR8K1Q8NGG5 319 aa13.4□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 TRIM31Q9BZY9 425 aa13.4□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 YY1AP1Q9H869 796 aa13.4□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 ATG3Q9NT62 314 aa13.4□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa13.4□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 MED23Q9ULK4 1368 aa13.4□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 TACC1O75410 805 aa13.39□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 TUBBP07437 444 aa13.39□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 GUCY1A2P33402 732 aa13.39□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 GCKP35557 465 aa13.39□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 USP14P54578 494 aa13.39□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 NNTQ13423 1086 aa13.39□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 KRT26Q7Z3Y9 468 aa13.39□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 FAM205CA6NFA0 338 aa13.39□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 KCNJ18B7U540 433 aa13.39□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 LTKP29376 864 aa13.39□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 KCNJ12Q14500 433 aa13.39□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 KRT31Q15323 416 aa13.39□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa13.39□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 WASF1Q92558 559 aa13.39□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 ARL8AQ96BM9 186 aa13.39□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 TUBE1Q9UJT0 475 aa13.39□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 IGSF1Q8N6C5 1336 aa13.39□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa13.39□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 KRT83P78385 493 aa13.39□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 GUCY2DQ02846 1103 aa13.39□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 RESP18Q5W5W9 173 aa13.39□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 ARHGEF25Q86VW2 580 aa13.39□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 TMEM139Q8IV31 216 aa13.39□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 OXER1Q8TDS5 423 aa13.39□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 PANX2Q96RD6 677 aa13.39□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 TRIM49BA6NDI0 452 aa13.38□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 MYBL2P10244 700 aa13.38□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 COPB1P53618 953 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 WTAPQ15007 396 aa13.38□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 TSGA10IPQ3SY00 556 aa13.38□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 AKAP4Q5JQC9 854 aa13.38□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 USPL1Q5W0Q7 1092 aa13.38□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 MSL1Q68DK7 614 aa13.38□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 APOA5Q6Q788 366 aa13.38□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa13.38□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 HSD3B7Q9H2F3 369 aa13.38□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 ZHX3Q9H4I2 956 aa13.38□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa13.38□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 TMCO5BA8MYB1 307 aa13.38□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 MARCH6O60337 910 aa13.38□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 CLTAP09496 248 aa13.38□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 NLRP5P59047 1200 aa13.38□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 MORC3Q14149 939 aa13.38□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa13.38□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 HDAC7Q8WUI4 952 aa13.38□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 IL17RAQ96F46 866 aa13.38□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 LRRC1Q9BTT6 524 aa13.38□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 GDAQ9Y2T3 454 aa13.38□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 NCK2O43639 380 aa13.38□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 GYPCP04921 128 aa13.38□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 CABP4P57796 275 aa13.38□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 ERVK-24P63145 666 aa13.38□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 PAK1Q13153 545 aa13.38□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 TCP11Q8WWU5 503 aa13.38□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 ABHD10Q9NUJ1 306 aa13.38□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 V9GY48 417 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 COL15A1P39059 1388 aa13.38□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
PRRX1-207ENST00000497230 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms