RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495040.1

PLXNA3-208, Transcript of plexin A3, human

TSL 5

Gene PLXNA3, Length 421 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PLXNA3-208	ENST00000495040	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	31.91	■■■□□ 2.7
PLXNA3-208	ENST00000495040	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	31.91	■■■□□ 2.7
PLXNA3-208	ENST00000495040	TRIB2	Q92519	343 aa		31.91	■■■□□ 2.7
PLXNA3-208	ENST00000495040	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	31.91	■■■□□ 2.7	2e-8	■■□□□ 12.4
PLXNA3-208	ENST00000495040	RGS2	P41220	211 aa		31.9	■■■□□ 2.7
PLXNA3-208	ENST00000495040	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	31.9	■■■□□ 2.7
PLXNA3-208	ENST00000495040	MORN1	Q5T089	497 aa		31.9	■■■□□ 2.7
PLXNA3-208	ENST00000495040	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		31.9	■■■□□ 2.7
PLXNA3-208	ENST00000495040	USP6NL	Q92738	828 aa		31.9	■■■□□ 2.7
PLXNA3-208	ENST00000495040	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		31.9	■■■□□ 2.7
PLXNA3-208	ENST00000495040	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		31.9	■■■□□ 2.7
PLXNA3-208	ENST00000495040	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	31.9	■■■□□ 2.7
PLXNA3-208	ENST00000495040	BTBD7	Q9P203	1132 aa		31.9	■■■□□ 2.7
PLXNA3-208	ENST00000495040	RPTOR	Q8N122	1335 aa		31.9	■■■□□ 2.7
PLXNA3-208	ENST00000495040	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	31.89	■■■□□ 2.7
PLXNA3-208	ENST00000495040	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		31.89	■■■□□ 2.7
PLXNA3-208	ENST00000495040	VCPKMT	Q9H867	229 aa		31.89	■■■□□ 2.7
PLXNA3-208	ENST00000495040	AAMP	Q13685	434 aa		31.88	■■■□□ 2.69
PLXNA3-208	ENST00000495040	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		31.88	■■■□□ 2.69
PLXNA3-208	ENST00000495040	FSD1	Q9BTV5	496 aa		31.88	■■■□□ 2.69
PLXNA3-208	ENST00000495040	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		31.88	■■■□□ 2.69
PLXNA3-208	ENST00000495040	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		31.88	■■■□□ 2.69
PLXNA3-208	ENST00000495040	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		31.87	■■■□□ 2.69
PLXNA3-208	ENST00000495040		M0R2C6	588 aa		31.87	■■■□□ 2.69
PLXNA3-208	ENST00000495040	SLC34A2	O95436	690 aa		31.87	■■■□□ 2.69
PLXNA3-208	ENST00000495040	TRIM32	Q13049	653 aa		31.87	■■■□□ 2.69
PLXNA3-208	ENST00000495040	RLF	Q13129	1914 aa		31.87	■■■□□ 2.69
PLXNA3-208	ENST00000495040	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		31.86	■■■□□ 2.69
PLXNA3-208	ENST00000495040	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	31.86	■■■□□ 2.69
PLXNA3-208	ENST00000495040	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	31.86	■■■□□ 2.69
PLXNA3-208	ENST00000495040	WDR78	Q5VTH9	848 aa		31.86	■■■□□ 2.69
PLXNA3-208	ENST00000495040	APBA2	Q99767	749 aa		31.86	■■■□□ 2.69
PLXNA3-208	ENST00000495040	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		31.86	■■■□□ 2.69
PLXNA3-208	ENST00000495040	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PLXNA3-208	ENST00000495040	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	31.85	■■■□□ 2.69
PLXNA3-208	ENST00000495040	APP	P05067	770 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PLXNA3-208	ENST00000495040	TDO2	P48775	406 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PLXNA3-208	ENST00000495040	ATP2B2	Q01814	1243 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PLXNA3-208	ENST00000495040	MAP2K5	Q13163	448 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PLXNA3-208	ENST00000495040	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PLXNA3-208	ENST00000495040	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PLXNA3-208	ENST00000495040	DPF3	Q92784	378 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PLXNA3-208	ENST00000495040	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	31.85	■■■□□ 2.69
PLXNA3-208	ENST00000495040	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PLXNA3-208	ENST00000495040	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PLXNA3-208	ENST00000495040	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	31.84	■■■□□ 2.69
PLXNA3-208	ENST00000495040	PTPRE	P23469	700 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PLXNA3-208	ENST00000495040	DSG3	P32926	999 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PLXNA3-208	ENST00000495040	MB21D1	Q8N884	522 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PLXNA3-208	ENST00000495040	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	31.83	■■■□□ 2.69
PLXNA3-208	ENST00000495040	FLOT1	O75955	427 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PLXNA3-208	ENST00000495040	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	31.83	■■■□□ 2.69
PLXNA3-208	ENST00000495040	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PLXNA3-208	ENST00000495040	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PLXNA3-208	ENST00000495040	CEP290	O15078	2479 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PLXNA3-208	ENST00000495040	RASA1	P20936	1047 aa		31.82	■■■□□ 2.68
PLXNA3-208	ENST00000495040	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		31.82	■■■□□ 2.68
PLXNA3-208	ENST00000495040	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		31.82	■■■□□ 2.68
PLXNA3-208	ENST00000495040	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	31.82	■■■□□ 2.68
PLXNA3-208	ENST00000495040	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		31.82	■■■□□ 2.68
PLXNA3-208	ENST00000495040	GOPC	Q9HD26	462 aa		31.82	■■■□□ 2.68
PLXNA3-208	ENST00000495040		A0A0G2JMZ2	1700 aa		31.82	■■■□□ 2.68
PLXNA3-208	ENST00000495040	CCL14	Q16627	93 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PLXNA3-208	ENST00000495040	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PLXNA3-208	ENST00000495040	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	31.81	■■■□□ 2.68
PLXNA3-208	ENST00000495040	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
PLXNA3-208	ENST00000495040	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PLXNA3-208	ENST00000495040	STAP2	Q9UGK3	403 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PLXNA3-208	ENST00000495040	PARP14	Q460N5	1801 aa		31.8	■■■□□ 2.68
PLXNA3-208	ENST00000495040	GRB14	Q14449	540 aa		31.8	■■■□□ 2.68
PLXNA3-208	ENST00000495040	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		31.8	■■■□□ 2.68
PLXNA3-208	ENST00000495040		H0YGN5	161 aa		31.79	■■■□□ 2.68
PLXNA3-208	ENST00000495040	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	31.79	■■■□□ 2.68
PLXNA3-208	ENST00000495040	HOXC6	P09630	235 aa		31.78	■■■□□ 2.68
PLXNA3-208	ENST00000495040	PDE1A	P54750	535 aa		31.78	■■■□□ 2.68
PLXNA3-208	ENST00000495040	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	31.78	■■■□□ 2.68
PLXNA3-208	ENST00000495040	EVI5L	Q96CN4	794 aa		31.78	■■■□□ 2.68
PLXNA3-208	ENST00000495040	ATG4C	Q96DT6	458 aa		31.78	■■■□□ 2.68
PLXNA3-208	ENST00000495040	NYAP2	Q9P242	653 aa		31.78	■■■□□ 2.68
PLXNA3-208	ENST00000495040	STRN	O43815	780 aa		31.77	■■■□□ 2.68
PLXNA3-208	ENST00000495040	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		31.77	■■■□□ 2.68
PLXNA3-208	ENST00000495040	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	31.77	■■■□□ 2.68
PLXNA3-208	ENST00000495040	NAPB	Q9H115	298 aa		31.77	■■■□□ 2.68
PLXNA3-208	ENST00000495040	ERCC3	P19447	782 aa		31.76	■■■□□ 2.67
PLXNA3-208	ENST00000495040	PLS1	Q14651	629 aa		31.76	■■■□□ 2.67
PLXNA3-208	ENST00000495040	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		31.76	■■■□□ 2.67
PLXNA3-208	ENST00000495040	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	31.76	■■■□□ 2.67
PLXNA3-208	ENST00000495040	MROH8	Q9H579	483 aa		31.76	■■■□□ 2.67
PLXNA3-208	ENST00000495040	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		31.76	■■■□□ 2.67
PLXNA3-208	ENST00000495040	RAD21	O60216	631 aa		31.75	■■■□□ 2.67
PLXNA3-208	ENST00000495040	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
PLXNA3-208	ENST00000495040	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	31.75	■■■□□ 2.67
PLXNA3-208	ENST00000495040	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		31.75	■■■□□ 2.67
PLXNA3-208	ENST00000495040	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		31.75	■■■□□ 2.67
PLXNA3-208	ENST00000495040	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		31.75	■■■□□ 2.67
PLXNA3-208	ENST00000495040	PRDM1	O75626	825 aa		31.74	■■■□□ 2.67
PLXNA3-208	ENST00000495040	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	31.74	■■■□□ 2.67
PLXNA3-208	ENST00000495040	PDE4B	Q07343	736 aa		31.74	■■■□□ 2.67
PLXNA3-208	ENST00000495040	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		31.74	■■■□□ 2.67
PLXNA3-208	ENST00000495040	MYH4	Q9Y623	1939 aa		31.73	■■■□□ 2.67

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