RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 GPSM2P81274 684 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAME-213ENST00000492657 C12orf60Q5U649 245 aa14.69□□□□□ -0.06
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PRAME-213ENST00000492657 STAG2Q8N3U4 1231 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAME-213ENST00000492657 CCDC112Q8NEF3 446 aa14.69□□□□□ -0.06
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PRAME-213ENST00000492657 CEP135Q66GS9 1140 aa14.68□□□□□ -0.06
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PRAME-213ENST00000492657 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
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PRAME-213ENST00000492657 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 TMEM51Q9NW97 253 aa14.63□□□□□ -0.07
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PRAME-213ENST00000492657 LY75O60449 1722 aa14.63□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 BAG3O95817 575 aa14.63□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 ZNF18P17022 549 aa14.63□□□□□ -0.07
PRAME-213ENST00000492657 KIF5BP33176 963 aa14.63□□□□□ -0.07
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