RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491134.5

PRDM2-209, Transcript of PR/SET domain 2, humanhuman

TSL 3

Gene PRDM2, Length 1,100 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2-209ENST00000491134 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
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PRDM2-209ENST00000491134 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa21.42■■□□□ 1.02
PRDM2-209ENST00000491134 EMILIN3Q9NT22 766 aa21.42■■□□□ 1.02
PRDM2-209ENST00000491134 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PRDM2-209ENST00000491134 EVCP57679 992 aa21.41■■□□□ 1.02
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PRDM2-209ENST00000491134 C19orf81C9J6K1 198 aa21.4■■□□□ 1.02
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PRDM2-209ENST00000491134 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa21.33■■□□□ 1.01
PRDM2-209ENST00000491134 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
PRDM2-209ENST00000491134 BTBD19C9JJ37 291 aa21.32■■□□□ 1
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PRDM2-209ENST00000491134 FGD1P98174 961 aa21.32■■□□□ 1
PRDM2-209ENST00000491134 ZNF543Q08ER8 600 aa21.32■■□□□ 1
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